With one click, MAXIMIZE the chance to obtain functional proteins
Try it Now
Patent Number: WO2020024917A1
jako přední poskytovatel syntetické DNA se GenScript věnuje používání nejnovějších pokroků k aktualizaci stávajících algoritmů pro zlepšení genové exprese. Naše nejnovější vývoj je GenSmart™ Kodonu Optimalizace, zdarma, uživatelsky příjemný on-line nástroj, který umožňuje optimalizovat design divokého typu nebo rekombinantní genové sekvence k vyšší expresi v prokaryotické a savčí expresní systémy.
GenSmart™ Codon Optimization využívá nově navržený algoritmus založený na „populační imunitní algoritmus“, který využívá jak populační genetiky a imunologických teorií. V tomto přístupu, více než 200 faktorů podílejících se na genové expresi, včetně GC obsah, kodon použití a obsah, index, RNase sestřih stránky, a cis-působící destabilizaci mRNA motivy jsou prověřeny a ověřeny. Namísto použití jediného faktoru, simulace na počítači, multifaktoriální přístup se používá k zajištění, že všechny klíčové faktory v určité cílové sekvence genu váhu. Výsledkem je, že každá optimalizace genu je plně přizpůsobena tak, aby maximalizovala šanci na získání funkčního a aktivního proteinu.
ve srovnání s podobnými nástroji je optimalizace kodonu GenSmart™ přístupnější a uživatelsky přívětivější. Všechny parametry jsou integrovány do algoritmu a nevyžadují od vás žádný vstup. Vše, co je zapotřebí, je vaše sekvence a požadovaný hostitelský organismus; o zbytek se postará optimalizační nástroj. Kromě toho lze vaše optimalizované sekvence snadno objednat pomocí systému okamžitých nabídek GenSmart™ nebo archivovat pro budoucí použití.
upgradováno! GenSmart™ Kodonu Optimalizace byla aplikována na 50 hostitelských organismů, včetně CHO, Lidská, E. coli, T buněk, Kvasinek, Hmyzu, Arabidopsis, Kukuřice, Rýže, Sója, Ovoce létat, etc.!
Proč GenSmart™ Kodonu Optimalizace
- Dostupnost: Zdarma, on-line nástroj; stačí jedno kliknutí na své optimální sekvence
- Komplexní faktorová Analýza: Přes 200 faktorů prověřeny a ověřeny
- Advanced Computing: Patentovaný populace imunitní algoritmus, aby zajistily co nejlepší výkon
- Jednotlivé Sekvence na Bázi: Vysoce přizpůsobené computing, aby se zabránilo hmotnost alokační zkreslení na klíčové faktory
- Snadné Objednávání: Bezproblémová integrace s GenSmart™ Instant Quote Systému
Co Data Říkají
GenScript Údaje
Cíl: zhodnotit výkon GenSmart™ Kodonu Optimalizační nástroj zvýšení exprese JNK3 a GFP proteiny.
Přístup: Naklonoval divokého typu a pořadí-optimalizované sekvence každého genu do expresního vektoru a hodnocena exprese proteinů ze tří různých klonů v CHO 3E7 buněk prostřednictvím Western blotting.
výsledky: Všechny tři GFP a JNK3 klony z optimalizované sekvence o GenSmart™ ukázala významné zvýšení exprese proteinů do 18 – a ~8-krát, respektive, ve srovnání s non-optimalizovaná nativní genové sekvence.
Nezávislé Údaje
Cíl: K posouzení úpravy účinnost BE4 základní editor varianty optimalizován různými kodonu optimalizace nástrojů jako součást zastřešující cíl zkoumat vliv genové exprese na genové editace
Přístup: Optimalizované jaderné lokalizace kodonu z BE4 nářadí od IDT, Coller, GeneArt a GenScript, a pak posoudit genové exprese a účinnosti úpravy v HEK293 buňky,
Výsledky: Zatímco kodony optimalizována pomocí nástrojů z GenScript (GS), GeneArt (GA) a Coller (JC) vylepšené editační účinnosti vzhledem k IDT, chimerická varianty optimalizované GenScript je kodonu optimalizace sám překonal ostatní je tím, že přiměje 1.8 násobně vyšší účinnosti úpravy