insulin-like growth factor-binding proteiny (IGFBP) nadčeleď

v posledních deseti letech, koncept IGFBP rodina byla dobře přijata, na základě strukturální podobnosti a na funkční schopnosti vázat Igf s vysokou afinitou. Existence dalších potenciálních Igfbp byla ponechána otevřená. Objev proteiny s N-terminální domény nesoucí nápadné strukturální podobnosti na N-konci IGFBPs a s omezenou, ale prokazatelné, afinitu k Igf, vznesl otázku, zda tyto proteiny byly „nové“ IGFBPs (22, 23, 217). N-terminální doména byla jednoznačně spojena s IGFBPs a dlouho byla považována za kritickou pro vazbu IGF. Pro tuto doménu nebyla dosud potvrzena žádná jiná funkce. Přítomnost této důležité igfbp domény v n-konci jiných proteinů tedy musí být považována za významnou. I když tyto jiné proteiny, objeví schopné vázat IGF, jejich relativně nízkou afinitu a skutečnost, že jejich hlavní biologické účinky jsou pravděpodobně ne přímo zapojit IGF peptidy naznačují, že pravděpodobně by nemělo být klasifikováno v rámci IGFBP rodiny jako předběžný návrh (22, 23). Zachování této jediné domény, tak kritické pro vazbu IGF s vysokou afinitou šesti Igfbp, ve všech IGFBP-RP, také hovoří o jeho biologickém významu. Historicky a možná i funkčně to vedlo k označení „nadčeledi IGFBP“. Klasifikace a nomenklatura pro nadčeledi IGFBP, jsou, samozřejmě, libovolný; co je nakonec relevantní, je základní biologie, z nichž většina ještě zbývá rozluštit. Nomenklatura proteinů souvisejících s IGFBP byla odvozena z konsensu vědců pracujících v oblasti IGFBP (52). Je zřejmé, že obecnějšího konsensu o nomenklatuře, který zahrnuje všechny skupiny pracující na každém IGFBP-rP, ještě nebylo dosaženo. Další pochopení biologických funkcí každého proteinu by mělo pomoci vyřešit dilema nomenklatury. V současné době redesignace těchto proteinů IGFBP-rPs zjednodušuje více názvů, které jsou již spojeny s každým proteinem souvisejícím s IGFBP, a posiluje koncept vztahu s Igfbp. Kromě N-terminální domény chybí strukturální podobnost mezi IGFBP-rPs a IGFBPs. C-terminální domény sdílejí podobnosti s jinými interními doménami nalezenými v mnoha dalších proteinech. Například, podobnost IGFBP C terminus do thyreoglobulinu typu domény ukazuje, že IGFBPs jsou také strukturálně souvisí s mnoha jinými proteiny, nesoucí stejné doméně (87). Zajímavé je, že funkce jednotlivých C-terminální domény v členy IGFBP nadčeleď zahrnuje interakce s povrchu buňky nebo ECM, což naznačuje, že, i když sdílejí malé pořadí podobnosti, C-terminální domény může být funkčně souvisí. Evoluční zachování N-terminální domény a funkční studie podporují názor, že IGFBPs a IGFBP-rPs tvoří IGFBP nadčeleď. Nadčeleď vymezuje mezi blízce příbuznými (klasifikovanými jako rodina) a vzdáleně příbuznými proteiny. Nadčeleď IGFBP se proto skládá ze vzdáleně příbuzných rodin. Modulární charakter složek IGFBP nadčeleď, zejména jejich zachování vysoce konzervované N-terminální domény, zdá se, že nejlépe vysvětlit proces exon shuffling předků, gen kódující tuto doménu. V průběhu evoluce, někteří členové se vyvinul do vysoké afinity IGF pojiva a ostatní do nízké afinitě IGF pojiva, čímž se uděluje na IGFBP nadčeleď schopnost ovlivňovat růst buněk tím, že oba IGF-závislé a IGF-nezávislé prostředky (Obr. 10). Poslední slovo od Stephena Jaye Goulda (218): „klasifikace však nejsou pasivní Objednávková zařízení ve světě objektivně rozděleném do zřejmých kategorií. Taxonomie jsou lidská rozhodnutí vnucená přírodě-teorie o příčinách řádu přírody. Kronika historických změn v klasifikaci poskytuje náš nejlepší pohled na koncepční revoluce

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.