O‘ Malley vyučoval 22 let angličtinu a teologii na McQuaid Jesuit High School v Rochesteru v New Yorku. Režíroval také školní hudební a činoherní inscenace.
do června 2012 vyučoval teologii, AP angličtinu a později volitelný předmět nazvaný problém Boha/morálky/manželství/otcovství na Fordham Preparatory School v Bronxu. Do roku 2003 byl mimořádným profesorem na School of Professional and Continuing Studies na Fordham University a později profesorem teologie a humanitních věd na Seattle University.
O ‚ Malley je nejlépe známý pro jeho zobrazení otce Dyera ve Vymítači ďábla, pro kterého byl také technickým poradcem. Podle jednoho zdroje byl prvním katolickým knězem, který ztvárnil kněze v komerčním filmu. Objevil se také v E! Pravdivý hollywoodský příběh o prokletí exorcisty. Režíroval 99 her a muzikálů se studenty i dospělými.
jako autor napsal O ‚ Malley 37 publikovaných knih, včetně volby být katolíkem, proč být katolíkem?, Bůh: nejstarší otázka, setkání s živým Bohem, budování vlastního svědomí a pátý týden. Jeho kniha Help My Unbelief získala v roce 2009 katolickou knižní cenu. Jeho knihy, Budete Nikdy Být Mladší: Dobrá Zpráva Duchovno pro Ty, Nad 60 let vyhrál Katolické Tiskové Asociace Book Award v roce 2016.
Na jevišti v Rochesteru, on se objevil jako Jim, gentleman, v inscenaci Skleněný Zvěřinec v Divadle na Kolejích a jako klerik v Rochester Společenství Hráčů výroby Moci a Slávě, Graham Greene.