vuonna 1697 kaksi galdan Boshugtu-kaanin sukulaista, Danjila ja Rabdan, antautuivat Qing Kangxille. Sen jälkeen heidän kansansa organisoitiin kahdeksi Oolodien lippukunnaksi ja asutettiin uudelleen nykyisen Bayankhongorin provinssin alueelle Mongoliaan. Vuonna 1731 viisisataa taloutta pakeni takaisin Dzungarin alueelle ja loput Oolodit karkotettiin Hulun Buiriin. Vuoden 1761 jälkeen osa heistä asutettiin uudelleen Arkhangain provinssiin.
dzungarit, jotka asuivat alueella, joka ulottui Kiinan muurin länsipäästä nykyiseen Itä-Kazakstaniin ja nykyisestä Pohjois-Kirgisiasta Etelä-Siperiaan (josta suurin osa sijaitsee nykyisessä xinjiangissa), olivat viimeinen Kiinaa uhannut paimentolaisvalta, mitä he tekivät 1600-luvun alusta 1700-luvun puoliväliin. 1680-luvulla alkaneiden tuloksettomien sotilaallisten konfliktien jälkeen mantšujen johtama Qing-dynastia (1644-1911) alisti Dzungarit 1750-luvun lopulla.Clarke väitti, että Qing-sotaretki 1757-58 ”merkitsi Dzungar-valtion lisäksi dzungarien täydellistä tuhoa kansana.”Kun keisari Qianlong johti Qing-joukot voittoon Dzungarin Oiratista (läntisistä) mongoleista vuonna 1755, hän alun perin aikoi jakaa Dzungarin kaanikunnan neljään heimoon, joita johti neljä kaania, Khoit-heimon piti saada Dzungarin johtaja Amursana Kaanikseen. Amursana hylkäsi Qing-järjestelyn ja kapinoi, koska halusi olla yhtenäisen Dzungar-kansakunnan johtaja. Tämän jälkeen Qianlong antoi määräyksensä koko Dzungarin kansan ja nimen kansanmurhasta ja hävittämisestä, Qing mantšu Bannermen ja Khalkha (itäiset) mongolit orjuuttivat dzungarin naisia ja lapsia surmaten samalla muut dzungarit.
keisari Qianlong määräsi tämän jälkeen dzungarien kansanmurhan, siirsi jäljelle jääneet dzungarit mantereelle ja määräsi kenraalit tappamaan kaikki Barkolin tai Suzhoun miehet sekä jakoi heidän vaimonsa ja lapsensa Qing-joukoille, jotka koostuivat mantšujen Vasalleista ja Khalkha-mongoleista. Qing-tutkija Wei Yuan arvioi Dzungarien koko väkiluvuksi ennen syksyä 600 000 ihmistä eli 200 000 kotitaloutta. Oirat-upseeri Saaral petti ja taisteli Oirateja vastaan. Wei Yuan kirjoitti, että noin 40% dzungarin kotitalouksista kuoli isorokkoon, 20% pakeni Venäjälle tai kazakstanilaisiin heimoihin ja 30% kuoli mantšujen Vasalliarmeijan ja Khalkha-mongolien Qing-armeijassa. Tämän sodan aikana kazakit hyökkäsivät hajallaan Oirats ja Altays. Tähän kertomukseen perustuen Wen-Djang Chu kirjoitti, että 80% vähintään 600 000 dzungarista (erityisesti Choros, Olot, Khoid, Baatud ja Zakhchin) tuhoutuivat taudin ja hyökkäyksen seurauksena, jota Michael Clarke kuvaili ”dzungarin valtion lisäksi zungarien kansana täydelliseksi tuhoksi.”Historioitsija Peter Perdue katsoi dzungarien harventamisen johtuneen Qianlongin aloittamasta nimenomaisesta hävittämispolitiikasta, mutta hän havaitsi myös merkkejä lievemmästä politiikasta vuoden 1757 puolivälin jälkeen. Mark Levene, historioitsija, jonka viimeaikaiset tutkimukset keskittyvät kansanmurhaan, on todennut, että dzungarien hävittäminen oli ”todennäköisesti kahdeksastoista vuosisadan kansanmurha par excellence.”Dzungarien kansanmurha päättyi isorokkoepidemian ja mantšujen Vasalleista ja (Khalkha) mongoleista koostuvien Qing-joukkojen suoranaiseen dzungarien teurastukseen.
Dzungarin vastaiset Uiguurikapinalliset Turfanin ja Hamin keitailta olivat alistuneet Qing-dynastian valtaan vasalleina ja pyytäneet Qing-dynastian apua Dzungarin vallan kukistamiseen. Uiguurijohtajille, kuten Emin Khojalle, myönnettiin arvonimiä Qing-aateliston piirissä, ja nämä uiguurit auttoivat Qing-joukkojen huoltamisessa dzungarin vastaisen kampanjan aikana. Qing käytti Khoja Eminiä kampanjassaan Dzungareita vastaan ja käytti häntä välittäjänä Tarimin altaan muslimien kanssa kertoakseen heille, että Qing-dynastian tavoitteena oli vain tappaa Dzungareita ja että he jättäisivät muslimit rauhaan, ja myös vakuuttaakseen heidät tappamaan dzungarit itse ja asettumaan Qing-dynastian puolelle, koska Qing huomasi muslimien paheksuvan aiempaa kokemustaan Dzungarien vallan alla Tsewang Araptanin käsissä.
vasta sukupolvia myöhemmin Dzungaria nousi uudelleen Dzungarien tuhosta ja lähes selvitystilasta lähes miljoonan dzungarien joukkosurmien jälkeen. Historioitsija Peter Perdue on osoittanut, että dzungarien tuhoaminen oli seurausta Qianlongin aloittamasta nimenomaisesta tuhoamispolitiikasta, Perdue katsoi dzungarien eliminoinnin johtuneen ”verilöylyn tahallisesta käytöstä” ja on kuvannut sitä ”etniseksi kansanmurhaksi”.
Qing-dynastian ”lopullinen ratkaisu” kansanmurhaan dzungarien ongelman ratkaisemiseksi mahdollisti miljoonien Han-kiinalaisten, Hui-intiaanien, Turkestanilaisten Keidaskansojen (uiguurit) ja mantšujen vasallien asuttamisen dzungariassa, koska maa oli nyt vailla dzungareita. Dzungarien aiemmin asuttama dzungarien allas on nykyisin kazakkien asuttama. Pohjois-Xinjiangiin Qing-dynastia toi Han -, Hui -, uiguuri -, Xibe-ja kazakstanilaiset siirtolaiset tuhottuaan Dzungar Oirat-mongolit alueella, ja kolmannes xinjiangin kokonaisväestöstä koostui Huista ja Hanista pohjoisella alueella, kun taas noin kaksi kolmasosaa oli uiguureja Etelä-Xinjiangin Tarimin altaassa. Dzungariaan Qing-dynastia perusti uusia kaupunkeja, kuten Urumqin ja Yiningin. Qing-dynastiat yhdistivät xinjiangin ja muuttivat sen väestötilannetta.
Pohjois-Xinjiangin väestökato buddhalaisten Oiraattien teurastuksen jälkeen johti siihen, että Qing-dynastian asukkaat asettuivat Mantšuiksi, Siboiksi (Xibe), Daureiksi, Soloneiksi, Han-kiinalaisiksi, Hui-muslimeiksi ja turkkilaisiksi Tarancheiksi pohjoisessa, ja Han-kiinalaiset ja Hui-siirtolaiset muodostivat suurimman osan uudisasukkaista. Koska Qing-dynastian harjoittama buddhalaisen Öölödin (Dzungarien) murskaaminen johti islamin edistämiseen ja Muslimikerjäläisten voimaannuttamiseen Etelä-xinjiangissa sekä muslimien Taranchien muuttoon Pohjois-Xinjiangiin, Henry Schwarz ehdotti, että ”Qing-dynastian voitto oli tietyssä mielessä voitto islamille”. Xinjiang yhtenäisenä määriteltynä maantieteellisenä identiteettinä luotiin ja kehitettiin Qing-dynastian avulla. Se oli Qing, joka johti Turkin muslimien valta alueella kasvaa, koska mongolien valta murskattiin Qing, kun taas turkin muslimi kulttuuri ja identiteetti oli suvaittu tai jopa edistää Qing.
Qianlong nimenomaan muisteli Qing-dynastian valloitettua Dzungareita siten, että he lisäsivät xinjiangissa uusia alueita ”Kiinaan”, määrittelemällä Kiinan monietniseksi valtioksi, hyläten ajatuksen, että Kiina tarkoitti vain han-alueita ”varsinaisessa Kiinassa”, eli Qing-dynastian mukaan sekä Han-että ei-Han-kansat olivat osa ”Kiinaa”, johon kuului myös Xinjiang, jonka Qingit valloittivat Dzungareilta. Kun Qingit olivat vallanneet Dzungarian vuonna 1759, he julistivat, että uusi maa, joka aiemmin kuului Dzungareille, liitettiin nyt ”Kiinaan” (Dulimbai Gurun) Mantšukielisessä muistomerkissä. Qing selitti ideologiaansa, että he kokosivat ”ulkopuoliset” ei-Han-kiinalaiset, kuten sisä-mongolit, Itä-mongolit, Oirat-mongolit ja tiibetiläiset yhdessä ”sisä -” Han-kiinalaisten kanssa ”yhdeksi perheeksi”, joka yhdistyi Qing-valtiossa, osoittaen, että Qing-dynastian eri alamaiset olivat kaikki osa yhtä perhettä, Qing käytti lausetta ”Zhong Wai Yi Jia” 中一一一 or (”sisä-ja ulkotilat yhtenä perheenä”), välittääkseen tämän ajatuksen.eri kansojen”yhdistymisestä”. Mantšujen virallisessa Tulisenin Mantšukielisessä kertomuksessa hänen tapaamisestaan Torghutin johtajan Ayuka-kaanin kanssa mainittiin, että vaikka Torghutit olivat toisin kuin venäläiset, ”Keski-valtakunnan kansa” (Dulimba-i gurun 中國, Zhongguo) oli kuin Torghut-mongolit, ja ”Keski-valtakunnan kansa” viittasi Mantšuihin.
Hulun Buir Oolodit muodostivat hallinnollisen bannerin Imin-ja Shinekhen-jokien varsilla. Qing-dynastian aikana joukko heistä asettui asumaan Yakeshin kaupunkiin. Vuonna 1764 monet Oolodit muuttivat Mongolian Hovdin provinssiin ja toimittivat corvee-palveluja Qing-dynastian Hovdin varuskunnalle. Heidän määränsä oli 9 100 vuonna 1989. He vaativat yhtenäistä hallintoyksikköä.
Xinjiangiin jääneet Dzungarit nimettiin myös Oolodeiksi. He hallitsivat Qing-dynastian aikana 30: tä mongolien 148 summasta ja vuonna 1999 heitä oli 25 000.