Inokulaatiomedit
laboratorion teknikot inokuloivat näytteen tietyille kiinteille agar-levyille juovalevymenetelmällä tai nestemäiseen viljelyaineeseen riippuen siitä, mikä eristyksen tavoite on:
- Jos halutaan eristää vain tietty bakteeriryhmä, kuten A-ryhmän streptokokki, voidaan käyttää selektiivistä viljelyainetta, joka estää sekoituksessa odotettavissa olevan samanaikaisen bakteerikasvun (agarissa olevien antibioottien avulla) siten, että vain streptokokit ”valikoituvat” eli erottuvat näkyvästi. Sienten eristämiseen voidaan käyttää Sabouraud agaria. Vaihtoehtoisesti streptokokkien ja gramnegatiivisten bakteerien tappavat olosuhteet, kuten mannitolin suola-agarin korkeat suolapitoisuudet suosivat kaikkien stafylokokkien selviytymistä suolistobakteerien näytteessä, ja agarin fenolipunainen toimii ph-indikaattorina, joka osoittaa, pystyvätkö bakteerit käymään mannitolia erittämällä happoa väliaineeseen. Muihin agar-aineisiin lisätään eliön kykyä tuottaa näkyvää pigmenttiä (esim. granada-väliaine B-ryhmän Streptokokeille), joka muuttaa bakteeripesäkkeiden väriä tai liuottaa veren agaria hemolyysillä, jotta ne voidaan helpommin havaita. Jotkin bakteerit, kuten Legionellalajit, tarvitsevat kasvaakseen tiettyjä ravintoaineita tai toksiineja kuten puuhiilessä, minkä vuoksi on käytettävä puskuroitua puuhiilihiivauuteagaria.
- Jos halutaan eristää mahdollisimman monta tai kaikkia kantoja, on rokotettava erilaisia ravinneaineita sekä rikastettuja väliaineita, kuten veriagaria ja suklaaagaria sekä anaerobisia viljelyaineita, kuten tioglykolaattiliemeä. Kasvun laskemiseksi bakteerit voidaan suspendoida sulaan agariin ennen kuin siitä tulee kiinteää, minkä jälkeen ne voidaan kaataa petrimaljoihin niin sanotulla pour plate-menetelmällä, jota käytetään ympäristömikrobiologiassa ja elintarvikemikrobiologiassa (esim.meijeritestaus) niin kutsutun aerobisen levymäärän määrittämiseksi.
Inkubaatioedit
sen jälkeen, kun näyte on inokuloitu valikoituun elatusaineeseen tai sen päälle, niitä inkuboidaan sopivissa ilmakehän olosuhteissa, kuten aerobisissa, anaerobisissa tai mikroaerofiilisissä olosuhteissa, tai lisättynä hiilidioksidilla (5%), eri lämpötiloissa, esimerkiksi 37 °C inkubaattorissa tai jääkaapissa kylmärikastusta varten, sopivassa valossa, esimerkiksi tiukasti ilman valoa paperiin käärittynä tai pimeässä pullossa skotokromogeenisten mykobakteerien varalta, ja eripituisia aikoja, koska eri bakteerit kasvavat eri nopeudella, vaihtelevasti tunneista (Escherichia coli) viikkoihin (esim.mykobakteerit).
laboratorion teknikot ja mikrobiologit tarkastavat väliaineen säännöllisin, sarjavälein näkyvän kasvun merkkien varalta ja tallentavat sen. Tarkastus on tehtävä olosuhteissa, jotka suosivat isolaatin selviytymistä, eli esimerkiksi anaerobisten bakteerien ”anaerobikammiossa”, ja olosuhteissa, jotka eivät uhkaa lautasia katselevaa henkilöä erityisen tarttuvan mikrobin tartuttamisella, eli esimerkiksi Yersinia pestisin (rutto) tai Bacillus anthracisin (pernarutto) biologisessa turvakaapissa.
Tunnistemedit
kun bakteerit ovat näkyvästi kasvaneet, ne ovat usein vielä sekoittuneet. Mikrobin tunnistaminen riippuu yksittäisen yhdyskunnan eristämisestä, sillä mikrobin biokemiallinen testaus sen erilaisten fysiologisten ominaisuuksien määrittämiseksi riippuu puhtaasta culture.To tee alakulttuuri, yksi taas toimii aseptisen tekniikan mikrobiologiassa, nostamalla yhden pesäkeen agar-pinnalta silmukalla ja raitoja materiaalin agar-levyn 4 kvadranttiin tai kaikkialle, jos siirtokunta oli yksikössä eikä näyttänyt sekoittuneelta.
raa ’ an näytteen värjääminen ennen inkubaatiota tai vasta kasvatetun pesäkemateriaalin värjääminen auttaa määrittämään, koostuuko pesäke tasaisesti esiintyvistä bakteereista vai onko se sekoittunut, ja bakteerien väri ja muoto mahdollistavat ensimmäisen morfologiaan perustuvan luokittelun. Kliinisessä mikrobiologiassa käytetään lukuisia muita värjäystekniikoita tietyille eliöille (happonopea bakteeritahra mykobakteereille). Immunologisia värjäystekniikoita, kuten suoraa immunofluoresenssia, on kehitetty lääketieteellisesti tärkeille patogeeneille, jotka ovat hidaskasvuisia (Auramiini-rodamiinitahra mykobakteereille) tai vaikeasti kasvavia (kuten Legionella pneumophila-lajit) ja joissa testitulos muuttaisi tavanomaista hoitoa ja empiiristä hoitoa.
bakteerien biokemiallinen testaus edellyttää agar-sarjaa injektiopulloissa liikkumattoman ja liikkumattoman aineen erottamiseksi toisistaan. bacteria.In 1970 kehitettiin pienoisversio, jota kutsutaan analyyttiseksi profiilaindeksiksi.
onnistunut tunnistaminen mm. genomin sekvensointi ja genomiikka riippuu puhtaista kulttuureista.