With one click, MAXIMIZE the chance to obtain functional proteins
Try it Now
Patent Number: Wo2020024917a1
johtavana synteettisen DNA: n tarjoajana GenScript on omistautunut käyttämään uusimpia edistysaskeleita päivittääkseen olemassa olevia algoritmeja geeniekspression parantamiseksi. Viimeisin kehitystyömme on gensmart™ Codon optimointi; ilmainen, käyttäjäystävällinen verkkotyökalu, jonka avulla voit optimoida villin tyypin tai rekombinanttien geenisekvenssien suunnittelun kohti korkeampaa ilmentymistä prokaryoottisissa ja nisäkkäiden ilmaisujärjestelmissä.
Gensmart™-Kodonioptimoinnissa käytetään uudelleen suunniteltua algoritmia, joka perustuu ”Populaatioimmuniteettialgoritmiin”, joka hyödyntää sekä populaatiogenetiikan että immunologian teorioita. Tässä lähestymistavassa seulotaan ja validoidaan yli 200 tekijää, jotka liittyvät geeniekspressioon, mukaan lukien GC-sisältö, kodonin käyttö ja sisältöindeksi, RNaasi-liitossivustot ja cis-toimivat mRNA-epävakauttavat kuviot. Sen sijaan, että laskentaan sovellettaisiin yksikertaista simulaatiota, käytetään monitekijäistä lähestymistapaa sen varmistamiseksi, että kaikki tietyn kohdegeenisekvenssin avaintekijät kantavat painoa. Tämän seurauksena jokainen geenin optimointi on täysin räätälöity maksimoimaan mahdollisuus saada toimiva ja aktiivinen proteiini.
vastaaviin työkaluihin verrattuna GenSmart™ Codon optimointi on helppokäyttöisempää ja käyttäjäystävällisempää. Kaikki parametrit on integroitu algoritmiin ja vaadi syöttöä sinulta. Kaikki, mitä tarvitaan, on sekvenssi ja haluttu isäntäorganismi; loput hoidetaan optimointityökalulla. Lisäksi optimoidut sekvenssit voidaan helposti tilata Gensmart™ Instant Quote-järjestelmän kautta tai arkistoida tulevaa käyttöä varten.
päivitetty! GenSmart™ kodon optimointi on sovellettu 50 isäntäeliöitä nyt, mukaan lukien cho, ihmisen, E. coli, T-solu, hiiva, hyönteinen, Arabidopsis, maissi, riisi, soija, Hedelmäkärpänen, jne.!
Why GenSmart™ Codon Optimization
- Accessibility: Free, online tool; vain yhden klikkauksen päässä optimaaliseen sekvenssiin
- Comprehensive Factor Analysis: Over 200 factors screened and validated
- Advanced Computing: patentoitu populaation immuunialgoritmi parhaan tuotoksen varmistamiseksi
- Individual Sequence-Based: Erittäin räätälöity tietojenkäsittely, jotta vältettäisiin painonjaon vinoutuminen avaintekijöihin
- Helppo tilaus: saumaton integrointi Gensmart™ Instant Quote System
mitä tiedot sanovat
GenScript Data
tavoite: arvioida Gensmart™ kodonin optimointityökalun suorituskykyä jnk3-ja GFP-proteiinien ilmentymisen lisäämisessä.
lähestymistapa: kloonattiin kunkin geenin villit tyyppi-ja sekvenssioptimoidut sekvenssit ekspressiovektorissa ja arvioitiin kolmen eri kloonien proteiiniekspressiota cho 3e7-soluissa Western blottingin avulla.
tulokset: Kaikki kolme GFP – ja jnk3-kloonia gensmart™: n optimoimista sekvensseistä osoittivat proteiinin ilmentymisen lisääntyneen merkittävästi 18-ja ~8-kertaisesti verrattuna optimoimattomiin alkuperäisiin geenisekvensseihin.
riippumattomat tiedot
Objective: to assess the editing efficiency of BE4 base editor variants optimoitu eri kodonien optimointityökaluilla osana yleistä tavoitetta tutkia geeniekspression vaikutusta geenien muokkaukseen
lähestymistapa: Optimoi BE4: n ydinkäyttöisen kodonin IDT: n, Collerin, Geneartin ja Genscriptin työkaluilla ja arvioi sitten geeniekspression ja muokkaustehokkuuden hek293-soluissa
tulokset: genscriptin (GS), Geneartin (GA) ja Collerin (JC) työkaluilla optimoidut kodonit paransivat editointitehokkuutta verrattuna IDT: hen, mutta pelkästään genscriptin kodonioptimoinnin optimoimat kimeeriset muunnokset päihittivät muiden kodonikodonit indusoimalla 1,8 kertaa suuremman editointitehokkuuden