insuliini-like growth factor-binding protein (IGFBP) superperhe

viime vuosikymmenen aikana igfbp-perheen käsite on hyväksytty hyvin perustuen rakenteellisiin samankaltaisuuksiin ja toiminnallisiin kykyihin sitoa IGF: iä, joilla on suuri affiniteetti. Muiden mahdollisten Igfbp: iden olemassaolo jätettiin avoimeksi. Sellaisten proteiinien löytäminen, joilla on n-terminaalisia domeeneja, joilla on silmiinpistäviä rakenteellisia yhtäläisyyksiä IGFBPs: n n-terminaaliin, ja joiden affiniteetti IGFs: ään on vähentynyt, mutta todistettavasti, herätti kysymyksen, olivatko nämä proteiinit ”uusia” IGFBPs: iä (22, 23, 217). N-terminaalinen domain oli liitetty ainutlaatuisesti IGFBPs: ään ja sitä on pitkään pidetty kriittisenä IGF-sidonnaisuuden kannalta. Tälle verkkotunnukselle ei ole toistaiseksi vahvistettu muita funktioita. Näin ollen tämän tärkeän IGFBP-domeenin esiintymistä muiden proteiinien N-terminaalissa on pidettävä merkittävänä. Vaikka nämä muut proteiinit näyttävät kykenevän sitoutumaan IGF: ään, niiden suhteellisen alhainen affiniteetti ja se, että niiden tärkeimmät biologiset vaikutukset eivät todennäköisesti liity suoraan IGF-peptideihin, viittaavat siihen, että niitä ei todennäköisesti pitäisi luokitella IGFBP-perheeseen, kuten alustavasti ehdotettiin (22, 23). Säilyttäminen tämän yhden verkkotunnuksen, niin kriittinen korkean affiniteetin Sitominen IGF kuusi IGFBPs, kaikissa IGFBP-rPs, samoin, puhuu sen biologista merkitystä. Historiallisesti ja ehkä myös toiminnallisesti tämä on johtanut ”IGFBP-superperheen” nimittämiseen. IGFBP: n superperheen luokittelu ja nimikkeistö ovat tietenkin mielivaltaisia; Viime kädessä olennaista on taustalla oleva biologia, josta suuri osa on vielä tulkitsematta. Igfbp: hen liittyvien proteiinien nimikkeistö on peräisin IGFBP: n alalla työskentelevien tutkijoiden yksimielisyydestä (52). On selvää, että vielä ei ole päästy yleisempään yksimielisyyteen nimikkeistöstä, johon osallistuisivat kaikki ryhmät, jotka työskentelevät kunkin IGFBP-rP: n parissa. Lisäymmärrys biologisten toimintojen kunkin proteiinin pitäisi auttaa ratkaisemaan nimikkeistö dilemma. Tällä hetkellä igfbp-rPs-proteiinien uudelleensuunnittelu yksinkertaistaa kaikkiin IGFBP-proteiineihin jo liitettyjä useita nimiä ja vahvistaa käsitystä suhteesta IGFBPs-proteiineihin. N-päätealueen lisäksi IGFBP-rPs: n ja IGFBPs: n välillä ei ole rakenteellista samankaltaisuutta. C-terminaalisilla domeeneilla on yhtäläisyyksiä muihin sisäisiin domeeneihin, joita löytyy lukuisista muista proteiineista. Esimerkiksi IGFBP C-Terminuksen samankaltaisuus tyroglobuliini tyyppi I-domeenin kanssa osoittaa, että Igfbp: t ovat rakenteellisesti sukua myös lukuisille muille saman domeenin kantaville proteiineille (87). Mielenkiintoista on, että IGFBP-superperheen jäsenten eri C-terminaalisten domeenien toiminnot sisältävät vuorovaikutuksia solun pinnan tai ECM: n kanssa, mikä viittaa siihen, että vaikka niillä on vähän sekvenssien yhtäläisyyksiä, C-terminaaliset domeenit voivat olla toiminnallisesti yhteydessä toisiinsa. N-terminaalisen domeenin evolutiivinen säilyminen ja funktionaaliset tutkimukset tukevat käsitystä, että IGFBPs ja IGFBP-rPs muodostavat yhdessä IGFBP-superperheen. Superperhe rajautuu läheistä sukua olevien (sukuun luokiteltavien) ja kaukaista sukua olevien proteiinien välillä. IGFBP: n superperhe koostuu siis kaukaista sukua olevista suvuista. IGFBP-superperheen rakenneosien modulaarinen luonne, erityisesti erittäin säilyneen N-terminaalisen domeenin säilyminen, näyttää parhaiten selitettävän tätä domeenia koodaavan esi-isien geenin eksonisekaantumisprosessilla. Evoluution kuluessa jotkut jäsenet kehittyivät korkean affiniteetin IGF-sideaineiksi ja toiset matalan affiniteetin IGF-sideaineiksi, jolloin IGFBP-superperheelle annettiin kyky vaikuttaa solujen kasvuun sekä IGF-riippuvaisilla että IGF-riippumattomilla keinoilla (Fig. 10). Viimeinen sana, Stephen Jay Gould (218): ”mutta luokitukset eivät ole passiivisia tilauslaitteita maailmassa, joka on objektiivisesti jaettu ilmeisiin luokkiin. Taksonomiat ovat ihmisen luonnolle määräämiä päätöksiä. teorioita luonnon järjestyksen syistä. Historiallisten luokittelumuutosten kronikka tarjoaa parhaimman käsityksen käsitteellisistä vallankumouksista

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.