Il dikaryon è una caratteristica nucleare che è unica per alcuni funghi. L’alga verde Derbesia è stata a lungo considerata un’eccezione, fino a quando l’ipotesi eterocariotica non è stata contestata da studi successivi. I tipi di cellule compatibili possono fondere i citoplasmi (plasmogamia). Quando ciò si verifica, i due nuclei di due cellule si accoppiano e convivono senza fondersi (cariogamia). Questo può essere mantenuto per tutte le celle delleph dividendo in modo sincrono in modo che le coppie vengano passate alle celle più recenti. Nell’Ascomycota questo attributo si trova più spesso nelleph ascogene e nell’ascocarpo mentre la maggior parte del micelio rimane monocariotica. Nel Basidiomycota questa è la fase dominante, con la maggior parte dei monokaryons Basidiomycota debolmente crescente e di breve durata.
La formazione di un dikaryon è un carattere plesiomorfo per il sottodominio Dikarya, che consiste nel Basidiomycota e l’Ascomycota. La formazione di croziers nell’Ascomycota e dei collegamenti del morsetto nel Basidiomycota facilita il mantenimento dei dikaryons. Tuttavia, alcuni funghi in ciascuno di questi phyla hanno evoluto altri metodi per mantenere i dikaryons, e quindi né croziers né connessioni a morsetto sono onnipresenti in entrambi i phylum.