フランスに対するナポレオンの動揺は、戦争での彼の成功に最初から依存していました。 1797年に北イタリアを征服し、第一次連合が解散した後、イギリス、フランスの世紀の長いライバル、そして最後に残った交戦国に侵攻することを意図していた。 しかし、フランスの海軍力は海の侵略を維持することができないと結論づけ、政府はナポレオンを代わりにエジプトへの軍事遠征に派遣し、イギリスのインド帝国への主要なルートを遮断することを望んだ。 遠征隊が病気と軍事的膠着状態に陥ったとき、その指揮官は静かにイギリスの海上封鎖を過ぎてフランスに戻り、（エジプトからの正確なニュースがない場合）彼は国家の主要な軍事英雄として受け取られた。
ブルメールのクーデターの時、共和国の軍隊は第二の連合によってイタリアから追い出されていたが、ロシア、オーストリア、イギリスの軍隊によるフランスへの多面体攻撃を停止していた。 言い換えれば、共和国はもはや差し迫った軍事的危険にさらされていませんでしたが、無限の戦争の見通しが地平線に迫っていました。 ブルメールの後、国家は新しい指導者が決定的な軍事的勝利によって平和を達成することを期待した。 ナポレオンはこの約束を果たし、再びフランス軍を北イタリアに導き、1800年6月のマレンゴの戦いでオーストリアを破った。 その後のドイツでの敗北により、オーストリアは1801年にルーネヴィルの講和条約に調印した。 二度目の大陸同盟国を奪われ、戦争に疲れた英国は最終的に交渉することを決めました。 1802年、フランスとイギリスはアミアン条約に調印し、10年ぶりにヨーロッパは平和になった。しかし、二年以内に、二つのライバルは再び戦争の状態にありました。
ほとんどの歴史家は、どちらも覇権のための野心を放棄しないので、どちらの帝国の力は、この平和の崩壊のために単独で責任がなかったことに同意 ナポレオンは、ピエモンテを併合し、バタヴィア共和国を占領し、シサルピネ共和国の大統領に就任することによって、条約の精神に繰り返し違反した。 イギリスにとって、ヨーロッパにおける権力のバランスは、独立したイタリアとオランダを必要とした。 しかし、イギリスは条約の手紙に違反し、マルタ島を約束したように避難させなかった。
再び、英国の海軍力は、英国の土壌に直接戦争を取るナポレオンの試みを挫折させ、英国が1805年に新しい大陸連合を形成することができたまで、実際の戦闘はほとんどありませんでした。 トラファルガーの戦い（1805年10月21日）では、イギリス海軍の砲手がフランス艦隊とスペイン艦隊を間引き、海峡横断の侵略のすべての考えを終わらせた。 ナポレオンは代わりにイギリスのオーストリアとロシアの同盟国に反対した。 彼はウルムでオーストリア軍を驚かせ、アウステルリッツの戦い（1805年12月2日）で決定的に破り、おそらく彼の最も華麗な戦術的な偉業を達成した。 プレスブルク条約（フランス外相シャルル＝モーリス-ド-タレイランからはあまりにも厳しいと批判された）の下で、オーストリアは重い補償を支払い、ヴェネツィアとチロルの州を割譲し、ナポレオンに神聖ローマ帝国を廃止させた。 プロイセンはハノーファーに対する主権の曖昧な約束によってしばらく中立を保ったが、最終的にフランスに対して動員され、1806年10月のイエナとアウエルシュテットの戦いで屈辱的な敗北を喫した。 フランスはベルリンを占領し、プロイセンに莫大な賠償金を課し、様々な州を占領し、北ドイツをフランスの影響力のある領域に変えた。 1807年2月8日のアイラウの戦い（英語版）では流血の膠着状態となり、ナポレオンは非常に脆弱な補給線を持つ不安定な海峡に取り残された。 しかし、その春に戦闘が再開されると、フリードラントの戦い（1807年6月14日）でフランス軍が勝利し、ツァール・アレクサンダー1世は和平を訴えた。 二人の皇帝によって交渉されたティルジット条約はヨーロッパを二つの勢力圏に分け、ナポレオンはオスマン帝国のライバルに対してロシアを支援することを約束し、アレクサンダーはイギリスに対して協力することを約束した。