GenSmart™ Codon Optimization

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With one click, MAXIMIZE the chance to obtain functional proteins

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Patent Number: WO2020024917A1

合成DNAのリーディングプロバイダーとして、GenScriptは、遺伝子発現を改善するための既存のアルゴリズムを更新するための最新の進歩を使用するこ 私達の最近の開発はGenSmart™のコドンの最適化である;原核生物および哺乳動物の表現システムのより高い表現の方の野生のタイプまたは組換えの遺伝子配列の設計を最大限に活用することを可能にする自由な、ユーザーフレンドリーのオンライン用具。

GenSmart™コドン最適化は、集団遺伝学と免疫学の両方の理論を利用した”集団免疫アルゴリズム”に基づいて新しく設計されたアルゴリズムを使用し このアプローチでは、GCコンテンツ、コドン使用量とコンテンツインデックス、RNaseスプライシングサイト、およびcis作用mRNA不安定化モチーフを含む遺伝子発現 単一因子シミュレーションを計算に適用する代わりに、特定の標的遺伝子配列内のすべての重要な因子が重量を運ぶことを保証するために多因子アプ その結果、各遺伝子の最適化は、機能的で活性なタンパク質を得る機会を最大化するために完全にカスタマイズされます。

同様のツールと比較して、GenSmart™コドン最適化は、よりアクセスしやすく、ユーザーフレンドリーです。 すべてのパラメータはアルゴリズムに統合されており、ユーザーからの入力は必要ありません。 必要なのはあなたの配列と目的の宿主生物だけです;残りは最適化ツールによって処理されます。 さらに、あなたの最大限に活用された順序はGenSmart™の即刻の引用システムを通して容易に発注されるか、または将来の使用のためにアーカイブするこ

アップグレードしました!

GenSmart™コドン最適化は、CHO、ヒト、大腸菌、T細胞、酵母、昆虫、シロイヌナズナ、トウモロコシ、米、大豆、ショウジョウバエなどを含む50の宿主生物に適用されています。!

なぜGenSmart™コドン最適化

  • アクセシビリティ:無料、オンラインツール;ワンクリックであなたの最適なシーケンスに
  • 包括的な因子分析:200以上の要因: 重要な要因の重量配分バイアスを避けるために高度にカスタマイズされたコンピューティング
  • 簡単な注文:GenSmart™インスタント引用システムとのシームレスな統

    アプローチ:発現ベクター内の各遺伝子の野生型および配列最適化された配列をクローニングし、ウェスタンブロッティングを介してCHO3E7細胞の三つの異

    結果

    結果: GenSmart™によって最適化された配列からのすべての三つのGFPおよびJNK3クローンは、非最適化された天然遺伝子配列と比較して、それぞれ18倍および-8倍

    独立したデータ

    目的:BE4ベースエディタバリアントの編集効率を評価するために、異なるコドン最適化ツールによって最適化されたコドン最適化ツールの一部として遺伝子編集に及ぼす遺伝子発現の影響を調査する包括的な目標

    アプローチ: BE4の核局在コドンをIDT、Coller、GeneArt、GenScriptのツールで最適化し、hek293細胞における遺伝子発現と編集効率を評価しました

    結果:GenScript(GS)、GeneArt(GA)、Coller(JC)のツールで最適化されたコドンは、IDTに比べて編集効率が向上しましたが、GenScriptのコドン最適化によって最適化されたキメラ変異体は、1.8倍の編集効率を誘導することによって他のものを上回っていました

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