RNasesは、実験室の酵素の中で悪党の超英雄のようなも 彼らは全能で、破壊的で、一見破壊的ではありません。これは、彼らが悪の君主によって作成されたためです,唯一の目的のために、高品質を生成するために毎日戦う勇敢な科学者のための生活を困難にします,無傷のRNAプレップ.わかりました、私は君主の部分について冗談を言っています。
しかし、なぜRNasesはとにかくそれらの超能力のすべてを持っていますか? そして、あなたはそれらを倒すために何ができますか? 調べてみよう
RNasesの超大国、説明しました。
Rnaseは全能である
これは本当です。 RNaseは、原核生物から真核生物までのすべての細胞型および生物に見出される。 つまり、彼らはどこにでもあります。 これは、彼らが研究室でこのような問題である主な理由の一つです。 彼らはあなたの体のあらゆる表面に、空気中に浮かんでいます。 つまり、彼らは空気、またはあなたの体の任意の表面が触れたものを汚染することを意味します。 これは基本的にすべてです。 また、特にRNase Aはガラスに非常に強く吸着し、ボトルなどから取り除くのがさらに難しくなります。
Rnaseは非常に破壊的である
Rnaseは、一般的に、その基質(RNA)に対して非常に高い比活性を有する。
Rnaseは非常に破壊的である。
これはRNaseの最も小さい量があなたの貴重なRNAの準備を通って容易に裂けることができることを意味する。 なお、これは、RNase(RNase A)がその触媒作用機構を推定した最初の酵素であった理由の1つでもある(Findlay et al1962)。
RNasesは一見不滅です
彼らはオートクレーブ後にフェニックスのような回復を表示します
Convential wisdomは、RNasesをオートクレーブすると変性しますが、冷却後に部分的 この驚くべき、伝説的な不屈の精神は、通常、所定の位置に3Dタンパク質構造を保持する水素結合が壊れている後でも、構造をそのまま保つ分子内ジスルフィド結合のシリーズによって可能になります。 すべての寓話のように、これはある程度真実です。 しかし、読んで、私たちは、この特定のスーパーパワーがRNase Baddies Inc.のspin doctorsによって宣伝されていることがわかります。EDTAでさえそれらを止めることはできません!
他のヌクレアーゼとは異なり、多くのRnaseは反応性種としてRNA基質の2プライムヒドロキシル基を使用するため、DNAを切断するヌクレアーゼのようにTEを添加するだけでは阻害されないため、触媒作用に金属イオンを必要としない。p>
どのように悪RNasesを倒すために
仲間の科学者、心配しないでください。 RNasesは手ごわい敵かもしれませんが、彼らは私たちが悪用できる弱点を持っています。
Hの中でそれらを蹴る
rnaseは、触媒作用のためにそれらの活性部位のヒスチジン残基に依存する。 したがって、ヒスチジン特異的アルキル化剤であるジエチルピロカーボネート(DEPC)は、それらを不活性化することができる。 オートクレーブに入れることはそれからあなたの他のどの蛋白質もalkalyatingからそれを停止するためにDEPCを、またはあなたのサンプル取除きます。
オートクレーブは、ある程度、動作しません
オートクレーブに直面してRNasesの多くの伝説的な不滅は、コアで真であるが、また、私は上記のように、非常に誇 Ambionからの素敵な小さな研究は、Rnase(または少なくともRNase A)がオートクレーブに完全に耐性ではないことを示しました。 むしろ、それらの活性はオートクレーブによって間引きされるが、RNase活性の小さな部分はオートクレーブ後に残る。しかし、少量のRNAseがまだ多くのRNAマンチングパワーを持っている場合。
これはあなたのRNaseの除去のプロシージャの一部として定期的なオートクレーブに入れることが確かに価値があることを意味します–それは活動すべてを取彼らは(乾燥した)熱に耐えることができません
湿った熱(オートクレーブ)がRNAsesを部分的に破壊する間、乾燥した熱に耐える希望はありません。
乾燥熱はRNAses–他のどの蛋白質でも強くあっても、酸化します。 だから、あなたのガラス製品を清掃するために、180℃で数時間それを行う必要があります。
化学戦争
表面を洗浄するために、rnasesは、彼らがそうであるように堅牢で、過酸化水素、強酸/塩基、Trizolなどのようなものを我慢することはできません。
これらはすべて、最も過酷なRNasesを取り除くために一般的に使用されています。Rnase用クリプトナイト
: 阻害剤
おそらく、我々はRnaseに対する私たちの武器庫で持っている最高の武器はRNase阻害剤です。 最も一般的には、市販のRNase阻害剤は、胎盤リボヌクレアーゼ阻害剤(RI)のバージョンです。 RNASE阻害剤の助けを借りずにRNA in situハイブリダイゼーションを完璧にしようとしている年を過ごす人として(私の上司による偽の経済のために!)、私はこのRNaseクリプトナイトがどれだけ良いかを知っています。 RIの一つのマイクロリットルと突然私の実験が働き始めました。
私は、上記の他のすべてのソリューションとは異なり、RNase阻害剤は特定のものであるため、これはRnaseに対する武器庫で最高の武器であると言います。 あなたがRNAで作業している場合は、このようなものなしではいけません。p>これはあなたを助けましたか?
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