Op 17 maart 1948 werd Chain benoemd tot fellow door de Royal Society.Op 8 juli 1969 werd Chain benoemd tot Ridder Bachelor.in 1948 trouwde hij met Anne Beloff-Chain, de zus van Renee Soskin, Max Beloff, John Beloff en Nora Beloff, en een biochemicus met een aanzienlijke reputatie. In zijn latere leven werd zijn Joodse identiteit steeds belangrijker voor hem. Chain was een vurig Zionist en hij werd lid van de Raad van bestuur van het Weizmann Institute of Science in Rehovot in 1954, en later lid van de Uitvoerende Raad. Hij voedde zijn kinderen veilig op binnen het Joodse geloof en regelde veel buitenschoolse lessen voor hen. Zijn opvattingen kwamen het duidelijkst tot uitdrukking in zijn toespraak ‘Why I am a Jew’, gegeven op de World Jewish Congress Conference of Intellectuals in 1965.Chain overleed in 1979 in het Mayo General Hospital. Het Imperial College London biochemistry building is naar hem vernoemd, net als een weg in Castlebar.