In 1874 ontdekten bouwvakkers de voetafdrukken. De Amerikaanse arts en archeologische verzamelaar, Earl Flint, bracht de voetafdrukken in 1884 onder de aandacht van de internationale wetenschappelijke gemeenschap en media.het Carnegie Institution of Washington begon met de eerste wetenschappelijke analyse en Opgravingen van het gebied in 1941 en 1942. Ze bouwden ook een museum en een gebouw om de voetafdrukken te beschermen.het werk werd in de jaren zestig en zeventig voortgezet door Joaquín Matilló, Allan L. Bryan en Jorge Espinosa. Bryan, van de Universiteit van Alberta, gebruikte koolstofdatering om de leeftijd van de grond bevochtigt te bepalen, van een begraven grond direct onder de voetafdrukken, tot 5.945±145 koolstofjaren vóór heden. Op basis van deze datum schatte hij dat de voetafdrukken dateerden van ongeveer 5.000 voor heden. Maar, later datering van de vulkanische afzettingen waarin ze voorkomen, bekend als de Masaya Triple Layer, toonde aan dat de fossiele sporen slechts ongeveer 2.120 ± 120 jaar oud zijn. In 1978 zette de Nicaraguaanse onderzoeker Jorge Espinosa de opgraving voort nabij het einde van de oorspronkelijke opgraving. Hij ontdekte meer voetafdrukken op een diepte van 4 meter. Het spoor wordt verondersteld verder te gaan.deze voetafdrukken zijn te zien in het Peabody Museum of Archaeology aan de Harvard University en in het United States National Museum.