17 marca 1948 roku Chain został mianowany członkiem Royal Society.8 lipca 1969 został mianowany kawalerem Orderu Odrodzenia Polski.
był dożywotnim przyjacielem profesora Alberta Neubergera, którego poznał w Berlinie w latach 30. XX wieku.
w 1948 roku ożenił się z Anne Beloff-Chain, siostrą Renee Soskin, Maxa Beloffa, Johna Beloffa i nory Beloff, a także biochemikiem o znaczącej pozycji. W późniejszym życiu jego Żydowska tożsamość stawała się dla niego coraz ważniejsza. Chain był zagorzałym syjonistą i w 1954 został członkiem Rady Gubernatorów Instytutu Naukowego Weizmanna w Rehovot, a później członkiem Rady Wykonawczej. Wychował swoje dzieci bezpiecznie w wierze żydowskiej, organizując dla nich wiele zajęć pozalekcyjnych. Jego poglądy wyraziły się w przemówieniu „Dlaczego jestem Żydem” wygłoszonym na konferencji intelektualistów Światowego Kongresu Żydów w 1965 roku.
Chain zmarł w szpitalu Mayo General Hospital w 1979 roku. Budynek Imperial College London biochemistry został nazwany jego imieniem, podobnie jak droga w Castlebar.