the insulin-like growth factor-binding protein (IGFBP) superfamily

w ciągu ostatniej dekady koncepcja rodziny IGFBP została dobrze przyjęta, w oparciu o podobieństwa strukturalne i funkcjonalne zdolności do wiązania IGF z dużymi powinowactwami. Istnienie innych potencjalnych IGFBPs pozostało otwarte. Odkrycie białek z domenami N-końcowymi niosącymi uderzające podobieństwa strukturalne do n końca IGFBPs i ze zmniejszonym, ale dającym się udowodnić powinowactwem do IGF, podniosło pytanie, czy te białka były „nowymi” IGFBPs (22, 23, 217). Domena N-końcowa była jednoznacznie powiązana z IGFBPs i od dawna była uważana za krytyczną dla wiązania IGF. Do tej pory nie potwierdzono żadnej innej funkcji dla tej domeny. Tak więc obecność tej ważnej domeny IGFBP w końcówce N innych białek musi być uważana za znaczącą. Chociaż te inne białka wydają się zdolne do wiązania IGF, ich stosunkowo niskie powinowactwo i fakt, że ich główne działania biologiczne prawdopodobnie nie dotyczą bezpośrednio peptydów IGF sugerują, że prawdopodobnie nie powinny być klasyfikowane w rodzinie IGFBP, jak wstępnie zaproponowano (22, 23). Zachowanie tej pojedynczej domeny, tak krytycznej dla wiązania IGF o wysokim powinowactwie przez sześć IGFBPs, we wszystkich IGFBP-RPS, jak również, mówi o jego znaczeniu biologicznym. Historycznie, i być może, funkcjonalnie, doprowadziło to do wyznaczenia „nadrodziny IGFBP”. Klasyfikacja i nomenklatura dla nadrodziny IGFBP, są, oczywiście, arbitralne; to, co jest ostatecznie istotne, to podstawowa Biologia, z których wiele nadal pozostaje do rozszyfrowania. Nomenklatura białek związanych z IGFBP pochodzi z konsensusu naukowców pracujących w dziedzinie IGFBP (52). Oczywiście nie udało się jeszcze osiągnąć bardziej ogólnego konsensusu w sprawie nomenklatury, obejmującego wszystkie grupy pracujące nad poszczególnymi IGFBP-rP. Dalsze zrozumienie funkcji biologicznych każdego białka powinno pomóc rozwiązać dylemat nazewnictwa. W chwili obecnej, przeprojektowanie tych białek IGFBP-rPs upraszcza wiele nazw już związanych z każdym białkiem związanym z IGFBP i wzmacnia koncepcję związku z Igfbp. Poza domeną N-terminalową brak jest strukturalnego podobieństwa między IGFBP – RPS i IGFBPs. Domeny C-końcowe mają podobieństwa do innych domen wewnętrznych występujących w wielu innych białkach. Na przykład podobieństwo końcówki C IGFBP do domeny tyreoglobuliny typu I pokazuje, że IGFBPs są również strukturalnie spokrewnione z wieloma innymi białkami noszącymi tę samą domenę (87). Co ciekawe, funkcje różnych domen C-końcowych w członkach nadrodziny IGFBP obejmują interakcje z powierzchnią komórki lub ECM, co sugeruje, że nawet jeśli mają niewielkie podobieństwa sekwencji, domeny C-końcowe mogą być funkcjonalnie powiązane. Ewolucyjna Ochrona domeny N-terminalnej i badania funkcjonalne wspierają pogląd, że IGFBPs i IGFBP-RPS razem tworzą nadrodzinę IGFBP. Nadrodzina dzieli się między blisko spokrewnionymi (klasyfikowanymi jako rodzina) i odlegle spokrewnionymi białkami. W związku z tym Nadrodzina IGFBP składa się z rodzin odlegle spokrewnionych. Modularny charakter składników nadrodziny IGFBP, w szczególności ich zachowanie wysoce zachowanej domeny N-końcowej, wydaje się najlepiej wyjaśnić procesem tasowania eksonów przodkowego genu kodującego tę domenę. W trakcie ewolucji, niektórzy członkowie ewoluowały w wysokiej powinowactwa IGF spoiwa i inne w niskiej powinowactwa IGF spoiwa, tym samym nadając nadrodzinie IGFBP zdolność do wpływania na wzrost komórek zarówno przez IGF zależnych i IGF niezależnych środków (Fig. 10). Ostatnie słowo, od Stephena Jaya Goulda (218): „ale klasyfikacje nie są biernymi urządzeniami porządkującymi w świecie obiektywnie podzielonym na oczywiste kategorie. Taksonomia to ludzkie decyzje narzucone naturze-teorie o przyczynach porządku natury. Kronika historycznych zmian w klasyfikacji daje nam najlepszy wgląd w koncepcyjne rewolucje

Dodaj komentarz

Twój adres e-mail nie zostanie opublikowany.