i 1874 opdagede bygningsarbejdere fodsporene. Den amerikanske læge og arkæologiske samler, Earl Flint, bragte fodsporene opmærksom på det internationale videnskabssamfund og medier i 1884.Carnegie begyndte den første videnskabelige analyse og udgravninger af området i 1941 og 1942. De byggede også et museum og en bygning for at beskytte fodsporene.i 1960 ‘erne og 1970’ erne blev arbejdet videreført af Joakim Matil, Allan L. Bryan og Jorge Espinosa. Bryan, fra University of Alberta, brugte radiocarbon-datering til at bestemme alderen på jordhumater, fra en begravet jord, der ligger direkte under fodsporene, til 5.945 liter 145 radiocarbon år før nutid. Baseret på denne dato anslog han, at fodsporene dateres til omkring 5.000 før nutid. Men senere datering af de vulkanske aflejringer, hvor de forekommer, kendt som Masaya Triple Layer, viste, at de fossile spor kun er omkring 2.120 til 120 år gamle. I 1978 fortsatte den nicaraguanske forsker Jorge Espinosa udgravningen nær afslutningen af den oprindelige udgravning. Han afdækkede flere fodspor i en dybde på 4 meter. Sporet menes at fortsætte videre.eksempler på disse fodspor kan ses på både Peabody Museum of Archaeology ved Harvard University og United States National Museum.