Varmedenaturering af DNA, også kaldet smeltning, får den dobbelte spiralstruktur til at slappe af for at danne enkeltstrenget DNA. Når DNA i opløsning opvarmes over dets smeltetemperatur (normalt mere end 80 liter C), afvikles det dobbeltstrengede DNA til dannelse af enkeltstrenget DNA. Baserne bliver unstacked og kan således absorbere mere lys. I deres oprindelige tilstand absorberer baserne af DNA lys i 260 nm bølgelængdeområdet. Når baserne bliver unstacked, ændres bølgelængden af maksimal absorbans ikke, men den absorberede mængde stiger med 37%. En dobbeltstrenget DNA-streng, der adskiller sig til to enkeltstrenge, producerer en skarp kooperativ overgang.
Hyperchromicitet kan bruges til at spore tilstanden af DNA som temperaturændringer. Overgangs – / smeltetemperaturen (Tm) er den temperatur, hvor absorbansen af UV-lys er 50% mellem maksimum og minimum, dvs.hvor 50% af DNA ‘ et denatureres. En ti gange stigning i monovalent kationkoncentration øger temperaturen med 16,6 liter C.
den hyperkromiske virkning er den slående stigning i absorbans af DNA ved denaturering. De to tråde af DNA er bundet sammen hovedsageligt ved stablingsinteraktioner, hydrogenbindinger og hydrofob virkning mellem de komplementære baser. Hydrogenbindingen begrænser resonansen af den aromatiske ring, så absorbansen af prøven er også begrænset. Når DNA – dobbeltspiralen behandles med denaturerede midler, forstyrres interaktionskraften, der holder den dobbelte spiralformede struktur. Den dobbelte spiral adskilles derefter i to enkeltstrenge, der er i den tilfældige oprullede konformation. På dette tidspunkt reduceres base-base-interaktionen, hvilket øger UV-absorbansen af DNA-opløsning, fordi mange baser er i fri form og ikke danner hydrogenbindinger med komplementære baser. Som et resultat vil absorbansen for enkeltstrenget DNA være 37% højere end for dobbeltstrenget DNA i samme koncentration.