Basalfäule, auch Zwiebelfäule genannt, weit verbreitete Pflanzenkrankheit, die durch eine Vielzahl von Pilzen und Bakterien verursacht wird, die alle Blumen- und Pflanzenzwiebeln infizieren können. Triebe treten nicht auf oder sind verkümmert, Blätter sind gelb bis rötlich oder violett, und sie welken später und sterben ab. Wurzeln, in der Regel wenige, sind verfärbt und verfallen. Die Fäulnis beginnt oft an der Zwiebelbasis (Wurzelplatte) und schreitet nach oben und außen voran. Pilzfäule ist normalerweise trocken bis schwammig oder pulverig und schimmelig, während Bakterienfäule häufig feucht, weich bis matschig und übelriechend ist. Die Fäulnis schreitet während der Lagerung an warmen, feuchten Orten oft schnell voran. Arten der Gattungen Botrytis, Fusarium, und Penicillium sind häufige Pilzmittel, Bakterielle Basalfäule wird häufig unter anderem durch Pectobacterium carotovorum und Pseudomonas viridiflava verursacht.
Die Kontrolle der Basalfäule umfasst die Verwendung von krankheitsfreien Zwiebeln; richtiges Pflanzen; sorgfältiges Graben und schnelles, aber gründliches Aushärten der Zwiebeln vor der Lagerung; Verwendung von Sorten, die gegen Pilzfäule resistent sind; Vermeidung von Überbewässerung, Überfüllung und Überdüngung; und Rotation mit Nicht-Zwiebelpflanzen. Baumschulen behandeln Zwiebeln häufig vor dem Verkauf mit einem Heißwasser-Fungizid-Tränken.