Sulfat-reduzierende Bakterien im menschlichen Kot und ihre Assoziation mit entzündlichen Darmerkrankungen

Abstract

Wir haben nach Sulfat-reduzierenden Bakterien im Kot von 41 gesunden Personen und 110 Patienten aus einer Hepato-Gastro-Enterologie-Einheit mit einem spezifischen flüssigen Medium gesucht (Test-Kit Labège®, Compagnie Française de Géothermie, Orléans, Frankreich). Die 110 Patienten wurden in 22 Patienten mit entzündlichen Darmerkrankungen und 88 Patienten aufgeteilt, die wegen anderer Erkrankungen des unteren (n = 30) oder oberen (n = 58) Verdauungstrakts ins Krankenhaus eingeliefert wurden. Sulfat-reduzierende Bakterien wurden von 10 gesunden Personen (24%), 15 Patienten mit entzündlichen Darmerkrankungen (68%) und 33 Patienten mit anderen Symptomen (37%) isoliert. Zur Identifizierung von Desulfovibrio piger (ehemals Desulfomonas pigra), Desulfovibrio fairfieldensis und Desulfovibrio desulfuricans wurde eine Multiplex-PCR entwickelt und auf die obigen Isolate angewendet. Die Stämme sulfatreduzierender Bakterien bestanden aus D. piger (39 Isolate), D. fairfieldensis (19 Isolate) und D. desulfuricans (ein Isolat). Die Prävalenz von D. piger war bei Patienten mit entzündlichen Darmerkrankungen (55%) im Vergleich zu gesunden Personen (12%) oder Patienten mit anderen Symptomen (25%) signifikant höher (P<0.05).

1 Einleitung

Morbus Crohn (CD) und Colitis ulcerosa (UC) sind chronisch entzündliche Darmerkrankungen (IBD) unbekannter Ätiologie, aber sie sind wahrscheinlich auf Umwelt-, genetische und Immunfaktoren angewiesen . Ein infektiöser Ursprung wurde vorgeschlagen, und viele Mikroorganismen wurden in Ermangelung überzeugender Argumente verwickelt. Bei beiden Syndromen spricht die Darmentzündung jedoch auf eine Antibiotherapie an. In Tiermodellen der chronischen Kolitis ist die Luminalflora ein essentieller Cofaktor für das Auftreten der Krankheit . Dies könnte das erneute Interesse an der Rolle der Darmflora als Ursache dieser Störungen erklären .Sulfatreduzierende Bakterien (SRB) sind anaerobe Mikroorganismen, die eine unterschiedliche Sulfatreduktion durchführen, um Energie zu gewinnen, was zur Freisetzung einer großen Menge Sulfid führt. Sie werden üblicherweise aus Umweltquellen isoliert, sind aber auch im Verdauungstrakt von Tieren und Menschen vorhanden. Als Desulfomonas pigra wurde als Desulfovibrio pigerosa umklassifiziert. Nov. , menschliche Isolate von SRB bestehen fast ausschließlich aus Desulfovibrio Spezies . Jüngste Ergebnisse deuten darauf hin, dass SRB eine Rolle bei menschlichen Krankheiten spielen kann. Sie wurden mit der klinischen Schwere der Parodontitis beim Menschen in Verbindung gebracht und aus tiefen Abszessen (Bauch oder Gehirn), Blut oder Urin isoliert . In diesen Umgebungen wurden die meisten Stämme als Desulfovibrio fairfieldensis identifiziert, eine kürzlich vorgeschlagene neue Spezies , durch 16S ribosomale RNA-Gen (16S rDNA) Sequenzierung. Desulfovibrio desulfuricans, die Typusart der Gattung Desulfovibrio, wurde auch aus menschlichen Proben isoliert . Die Implikation von SRB bei IBD wurde vorgeschlagen, da ihr metabolisches Endprodukt Schwefelwasserstoff eine zytotoxische Verbindung ist . Diese Verbindung kann durch eine Hemmung der Butyratoxidation, der Hauptenergiequelle für Kolonozyten, wirken. Die Beeinträchtigung der Funktionen des Darmepithels würde zu Zelltod und chronischer Entzündung führen. Die mit IBD assoziierten SRB-Arten wurden jedoch noch nicht identifiziert. Ihre Identifizierung würde es ermöglichen, sowohl nach Virulenzfaktoren als auch nach ihrer Anfälligkeit für antimikrobielle Mittel zu suchen.

In medizinischen Labors werden SRB aufgrund ihres langsamen Wachstums selten aus menschlichen Proben isoliert. Kolonien erscheinen nach mehr als 3 Tagen Inkubation und werden nicht bemerkt, da sie von der begleitenden Flora überwachsen sind, es sei denn, sie sind die dominierende oder einzige vorhandene Art. Daher ist ihre Suche im Kot schwierig, es sei denn, ein bestimmtes Medium wird verwendet. Solche Medien enthalten üblicherweise eine organische Verbindung (Elektronendonor und Kohlenstoffquelle), Sulfat (Elektronenakzeptor), Eisen und ein Reduktionsmittel. Das Wachstum von SRB in bestimmten Kulturmedien wird leicht durch eine Schwärzung des Mediums aufgrund der Schwefelwasserstoffproduktion (H2S) nachgewiesen, die zur Bildung eines Eisensulfidniederschlags führt. Nach der Isolierung aus klinischen Proben kann die Identifizierung auf Artenebene schwierig sein. Beispielsweise ist es nicht möglich, D. fairfieldensis und D. desulfuricans durch phänotypische Tests zu unterscheiden. Daher ist die Genamplifikation ein wertvolles Werkzeug, um eine solche Identifizierung zu erreichen.

Das Hauptziel dieser Studie war es zu bestimmen, welche Arten von Desulfovibrio mit IBD assoziiert sein können, wenn überhaupt. Zu diesem Zweck wurde ein spezifisches flüssiges Medium (Test-Kit Labège®, Compagnie Française de Géothermie, Orléans, Frankreich) für das Wachstum des SRB aus dem Kot gesunder Personen und von Patienten verwendet, die in der Abteilung für Hepato-Gastro-Enterologie des Centre Hospitalier et Universitaire de Nancy, Frankreich, hospitalisiert waren. Zur Identifizierung der Isolate auf Speziesebene wurde eine Multiplex-PCR entwickelt.

2 Materialien und Methoden

2.1 Patienten

Kot von 41 gesunden Personen (17 Männer und 24 Frauen; durchschnittsalter 38 Jahre, Bereich 1-101 Jahre) und 110 Patienten (67 Männer und 43 Frauen; Durchschnittsalter 57 Jahre, Bereich 14-100 Jahre) von der Hepato-Gastro-Enterologie-Abteilung des Centre Hospitalier et Universitaire de Nancy, Frankreich, wurden gesammelt. Gesunde Personen wurden nacheinander zu einer Untersuchung konsultiert. In ihrem Kot wurde kein pathogener Mikroorganismus gefunden. Gesunde Personen und Patienten hatten im Monat vor Erhalt der Probe keine Antibiotikaverabreichung. Die Patienten wurden in drei Gruppen eingeteilt: IBD (n = 22) umfasste 17 CD und fünf UC; andere Erkrankungen des unteren Darms (n = 30) umfassten 23 Patienten mit leichten oder mittelschweren Symptomen wie Bauchschmerzen, Darmtransitstörungen und Rektorrhagie sowie sieben Patienten mit Dickdarmkrebs; Erkrankungen des oberen Verdauungstrakts (n = 58) umfassten Gallensteine, Zirrhose, hepatozelluläres Karzinom, Magen- und Pankreastumoren. IBD wurden anhand klinischer, endoskopischer und histologischer Befunde diagnostiziert. Die meisten IBD-Patienten wiesen eine aktive Erkrankung auf (Tabelle 1).

2.2 SRB-Detektion und Enumeration

Ein Gramm Kot wurde mit 4 ml phosphatgepuffertem Kochsalzpuffer gemischt und zentrifugiert (3000 rpm, 5 min). Ein Milliliter Überstand wurde sofort in einem flüssigen Medium (Test-Kit Labège®, Compagnie Française de Géothermie, Orléans, Frankreich) nach Herstellerangaben beimpft. Kurz gesagt, die Testkits Labège® bestehen aus Fläschchen mit 9 ml eines bestimmten Mediums (organische Verbindungen: Lactat und Acetat, Reduktionsmittel: Titancitrat), das für den SRB-Nachweis anaerob konditioniert wurde. Es wird mit einer Spritze durch eine Gummikappe inokuliert. Dieses klare und farblose Medium wurde ursprünglich für den Nachweis von SRB aus Umweltproben entwickelt. Es wurde mit dem üblicherweise verwendeten Postgate-Festmedium E (organische Verbindung: Lactat, Reduktionsmittel: Ascorbinsäure und Thioglykolsäure) verglichen, das parallel unter anaerober Atmosphäre beimpft wurde. SRB wurden unter Verwendung langer und schmaler Röhrchen aufgezählt, die mit letzterem Medium gefüllt und mit dezimalen Verdünnungen der Fäkalien inokuliert wurden. Alle inokulierten Medien wurden 2 Monate bei 37°C inkubiert. Das Vorhandensein von SRB wurde durch die Bildung eines schwarzen Niederschlags (Eisensulfid) in flüssigen Medien und durch das Auftreten von schwarzen Kolonien in festen Medien festgestellt.

2.3 Design von PCR-Primern

Die in der GenBank-Datenbank verfügbaren 16S-rDNA-Sequenzen von Desulfomonas- und Desulfovibrio-Stämmen wurden mit der Sequence Navigator-Software, Version 1.0.1 (Applied Biosystems Inc., Foster City, CA, USA). Es erlaubte, sechs Primer für die Identifizierung durch PCR des SRB zu entwerfen, das zuvor vom Menschen isoliert worden war , bezogen jeweils auf D. piger (früher Desulfomonas pigra) ATCC 29098T, D. desulfuricans Essex 6 ATCC 29577T, D. desulfuricans MB ATCC 27774 und D. fairfieldensis ATCC 700045. D. desulfuricans Essex 6 und D. desulfuricans MB wurden differenziert, da die 16S-rDNA-Sequenzen dieser Stämme einen Unterschied von 3% aufweisen. Die Primer waren 27K-F (5′-CTG CCT TTG ATA CTG CTT AG-3′), 27K-R (5′-GGG CAC CCT CTC GTT TCG GAG A-3′), Essex-F (5′-CTA CGT TGT GCT AAT CAG CAG CGT AC-3′), Messe-F (5′-TGA ATG AAC TTT TAG GGG AAA GAC-3′), Schwein-F (5′-CTA GGG TGT TCT AAT CAT CAT CCT AC-3′) und P687-R (5′-GAT ATC TAC GGA TTT CAC TCC TAC ACC-3′) (Tabelle 2). Die Spezifität dieser Primer wurde an allen aus der GenBank-Datenbank verfügbaren Bakteriensequenzen mit dem Blast-Programm, Version 2.0 (National Center for Biotechnology Information, Bethesda, MD, USA), überprüft.

2.4 SRB identification by multiplex PCR

Four collection strains (D. piger ATCC 29098T, D. desulfuricans Essex 6 ATCC 29577T, D. desulfuricans MB ATCC 27774, and D. fairfieldensis ATCC 700045) and 12 clinical strains (two strains related to D. desulfuricans Essex 6, zwei mit D. desulfuricans MBverwandte Stämme und acht als D. fairfieldensis identifizierte Stämme) wurden als Positivkontrollen verwendet. Die Sensitivität der PCR wurde mit Verdünnungen quantifizierter Bakterienstamm-Suspensionen bewertet. Die Spezifität der PCR wurde mit Negativkontrollen einschließlich Typstämmen (Bilophila wadsworthia ATCC 49260T, Desulfovibrio gigas DSM 1382T, Desulfovibrio vulgaris DSM 644T) und üblichen klinischen Darmstämmen der folgenden Spezies überprüft: Bacteroides spröde, Bacteroides merdae, Bacteroides thetaiotaomicron, Bacteroides uniform, Bacteroides vulgatus, Campylobacter jejuni, Citrobacter freundii, Bakterien harmlos, Enterobacter römischen reich, Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium, Escherichia coli, Eubacterium kleine, Eubacterium klebrige, Fusobacterium nucleatum, Bakterien der kanal, Klebsiella oxytoca, Klebsiella pneumoniae, Morganella morganii, Peptostreptococcus big, Proteus wonderful, Proteus common, Providencia stuartii, Pseudomonas aeruginosa, Serratia marcescens, Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis und Streptococcus bovis.

Am Ende der Inkubationszeit wurden alle 151 inokulierten Testkits Labège® mit der Multiplex-PCR überprüft. DNA-Extrakte wurden aus 500 µl Kulturmedien nach Zentrifugation und Resuspension in TE–Puffer (10 mM Tris-HCl, 1 mM EDTA, pH 8) erhalten. Kurzzeitig wurden die Zellen nacheinander mit Lysozym (3 mg ml−1), SDS (1%, w/v) und Proteinase K (0,25 mg ml−1) lysiert. Nach einer Inkubation über Nacht bei 37°C wurde DNA nach der Standardmethode Phenol/Chloroform/Isoamylalkohol extrahiert. Jede 50-µl-PCR-Mischung enthielt 5 µl DNA-Extrakt (ca. 50 ng DNA) und Endmengen von 0,4 µM jedes Primers, 0,8 mM jedes Desoxynukleosidtriphosphats (Boehringer Mannheim Biochemicals, Mannheim, Deutschland), 0,4 mM Tris–HCl-Puffer, 1,5 mM MgCl2 und 1,5 U Taq-DNA-Polymerase (Gibco BRL Life Technologies, Paisley, UK). Alle Reaktionen wurden mit dem GeneAmp PCR System 2400 (Perkin-Elmer, Norwalk, CT, USA) durchgeführt. Nach einem anfänglichen Denaturierungsschritt von 94 ° C für 4 min folgten 30 Zyklen Denaturierung (94 ° C, 1 min), Glühen (55 ° C, 1 min) und Verlängerung (72 ° C, 2 min) sowie eine endgültige Verlängerung (72 ° C, 5 min). Negative (Wasser anstelle von DNA-Extrakt) und positive (D. fairfieldensis DNA-Extrakt) Kontrollen wurden in jeden Lauf aufgenommen. Amplifizierte Produkte wurden durch Elektrophorese in 1,5% (w/v) Agarosegelen, die Ethidiumbromid (1,6 mg ml−1) enthielten, aufgelöst. Als Größenmarker wurde eine 100-bp-DNA-Leiter verwendet (Gibco BRL Life Technologies, Rockville, MD, USA). D. piger, D. Entschwefelung Essex 6, D. desulfuricans MB und D. fairfieldensis wurden durch eine 255-, 255-, 396- bzw. 534-bp-Bande identifiziert. D. piger und D. desulfuricans Essex 6 wurden durch separate PCR-Assays unter Verwendung ihrer jeweiligen spezifischen Primer weiter differenziert. Für negative Proben wurde eine 16S-rDNA-Amplifikation unter Verwendung der Konsensusprimer 27f und 1525r durchgeführt, um das Fehlen einer Inhibition der PCRs durch Kontaminanten zu überprüfen.

3 Ergebnisse

3.1 SRB-Nachweis und Aufzählung

Bei gesunden Personen und gemäß den oben genannten Kriterien wurden SRB in 10 Fäkalien (24%) sowohl mit dem Test-Kit Labège® als auch mit dem Postgate-Medium gefunden. Bei Patienten aus der Hepato-Gastro-Enterologie-Einheit wurden SRB aus 42 Fäkalien mit Postgate-Medium gezüchtet. Drei weitere Proben wurden mit dem Test-Kit Labège® positiv befunden. So wurden unter den 110 untersuchten Patienten SRB durch Kultur bei 45 Patienten (41%) nachgewiesen. Drei weitere Proben ergaben zweideutige Ergebnisse mit dem Test-Kit Labège® (Vorhandensein eines dunkelbraunen Niederschlags). Die mittleren Nachweiszeiten des Wachstums von SRB betrugen 2 und 6 Tage mit dem Testkit Labège® (Bereich 1-11 Tage) bzw. Postgate’s Medium (Bereich 3-39 Tage). Die mittlere Anzahl von SRB im Kot gesunder Personen und Patienten betrug 105 g−1 (Bereich 102-109 g-1). Daher war die SRB-Anzahl nicht mit dem klinischen Status der Patienten verbunden.

3.2 SRB-Identifizierung durch Multiplex-PCR

Die Sensitivität des Multiplex-PCR-Assays betrug 100 Bakterien pro ml. Seine Spezifität wurde durch das Fehlen von Kreuzreaktionen zwischen den vier differenzierten Genospezies festgestellt. Jede Positivkontrolle wurde nur mit dem entsprechenden Satz von Primern als positiv befunden. Alle Stämme, die als Negativkontrollen zur Überprüfung der Spezifität verwendet wurden, einschließlich der Typenstämme von D. gigas und D. vulgaris, ergaben mit den vier Primersätzen negative Ergebnisse. Die Spezifität der Reaktionen wurde durch Sequenzierung der amplifizierten Produkte weiter bestätigt. Die erhaltenen Sequenzen entsprachen immer den erwarteten. Für SRB-negative Proben durch PCR, 16S rDNA-Amplifikation erlaubt, die Möglichkeit einer Hemmung der PCRs durch Verunreinigungen zu verwerfen.

Bei Patienten aus der Hepato-Gastro-Enterologie-Einheit ergaben die 45 positiven und die drei zweideutigen Fäkalien positive Ergebnisse durch PCR. Sie entsprachen D. piger (n=33), D. fairfieldensis (n=14) oder beiden (n=1). Es wurde keine D.-Entschwefelung nachgewiesen (Tabelle 3). Die kulturnegativen Kolben waren ebenfalls durch PCR negativ.

3.3 Beziehung von Desulfovibrio-Arten zu IBD

Die Verteilung der Arten unterschied sich nicht signifikant beim Vergleich von gesunden Personen und Patienten mit nicht entzündlichen Darmerkrankungen. D. piger war kaum häufiger als D. fairfieldensis. Umgekehrt war D. piger bei Patienten mit IBD 4-mal häufiger als D. fairfieldensis. Dieser Unterschied machte sich besonders bei CD bemerkbar, da IBD-Patienten hauptsächlich aus CD-Patienten bestanden. Die Prävalenz von D. piger war bei Patienten, die wegen IBD ins Krankenhaus eingeliefert wurden, signifikant höher als bei gesunden Personen oder Patienten, die wegen anderer Pathologien ins Krankenhaus eingeliefert wurden (P<0, 05). Es bestand kein Zusammenhang zwischen dem Stadium der Erkrankung und dem Vorhandensein von SRB. Die Therapie veränderte die Isolationsrate dieser Bakterien nicht.

4 Diskussion

Das Vorhandensein von SRB im Darmtrakt von Tieren und Menschen ist seit langem bekannt, obwohl Identifizierungen auf Artenebene selten durchgeführt wurden. Unsere Ergebnisse bestätigen, dass diese Bakterien häufige Bewohner des Darmtrakts des Menschen sind. Die meisten Studien zum intestinalen SRB von IBD-Patienten stützten sich auf eine kultivierungsbasierte mikrobiologische Analyse von Stuhlproben und identifizierten daher SRB auf Genusebene . Neuere Studien haben jedoch darauf hingewiesen, dass die mögliche Rolle von SRB bei der Pathogenese von IBD mit physiologischen und / oder phylogenetischen Unterschieden zwischen SRB-Stämmen zusammenhängen kann . Daher haben wir eine Multiplex-PCR entwickelt, um diese Bakterien auf Artenebene zu identifizieren. In Anbetracht der Schwierigkeit der Isolierung und der Seltenheit spezifischer Suchen wird die Prävalenz von SRB in klinischen Proben des Menschen sicherlich unterschätzt. Das für den Nachweis von SRB aus Umweltproben entwickelte Testkit Labège® erwies sich als geeignetes Medium zum Nachweis von SRB sowohl aus Kot als auch aus Körperflüssigkeiten (Loubinoux, unveröffentlichtes Ergebnis). Es wurde vom Hersteller gezeigt, dass es Umweltstämme von SRB wie D. desulfuricans DSM 1926, Desulfotomaculum nigrificans DSM 574T, Desulfobacter postgatei DSM 2034T und Desulfobulbus propionicus DSM 2032T züchtet. In unseren Händen erwies es sich als empfindlicher als das üblicherweise verwendete Postgate-Medium, da sechs zusätzliche Isolate von Desulfovibrio bei Patienten nachgewiesen wurden. Trotz der reichhaltigen Begleitflora ermöglichte das Testkit Labège® ein schnelles Wachstum des SRB aus Stuhlproben, da die mittlere Nachweiszeit 2 Tage betrug (gegenüber 6 Tagen im Postgate-Medium). Dies kann mit der Qualität des Mediums zusammenhängen, aber auch mit der Art der Inokulation von Proben, die die Aufrechterhaltung einer strengen Anaerobiose gewährleistet. Im Vergleich zum Postgate-Medium erweitert die Zugabe von Acetat zu Lactat das Nachweisspektrum um langsam wachsendes acetatmetabolisierendes SRB wie Desulfobacter spp. Darüber hinaus ermöglicht die Anwesenheit von Titancitrat, einem sehr effizienten Reduktionsmittel (das Redoxpotential von Test-kit Labège® beträgt etwa -600 mV), einen schnelleren Nachweis der meisten SRB-Stämme.

Es ist möglich, dass einige SRB-Stämme von den Testkits Labège® nicht nachgewiesen wurden, da sie von der Begleitflora überwachsen waren oder aufgrund einer geringen Anzahl in den Proben. Das Testkit Labège® ist jedoch an das Wachstum der meisten SRB angepasst, und alle positiven Kolben wurden durch PCR als D. piger, D. fairfieldensis oder D. desulfuricans identifiziert. Trotz der Inkubationszeit von 2 Monaten konnte keine zusätzliche Spezies nachgewiesen werden. Somit ist es möglich, dass unsere Befunde der realen menschlichen Flora entsprechen, die fast ausschließlich aus D. piger und D. fairfieldensis besteht. D. desulfuricans wurde einmal isoliert und wurde auch beim Menschen in einer früheren Studie beschrieben , aber es ist wahrscheinlich ungewöhnlich im Darmtrakt. In den meisten Fällen D. piger und D. fairfieldensis schlossen sich gegenseitig aus. Eine Assoziation beider Arten wurde nur einmal in einem Fall von Dickdarmkrebs beobachtet. Um das fast nicht überlappende Vorkommen von D. piger und D. fairfieldensis zu bestätigen, wurden fünf Kolonien von SRB, die in festem Postgate-Medium gezüchtet wurden, durch PCR für jedes positive Testkit Labège® identifiziert. In jedem Fall wurde das gleiche Ergebnis erhalten und die fünf Kolonien gehörten derselben Art an (Daten nicht gezeigt). Wir haben auch ein Follow-up von 10 Patienten (fünf SRB-positive und fünf SRB-negative) für 2 Monate und Stühle wurden jede Woche kultiviert. Für jeden Patienten wurde das gleiche Ergebnis (SRB-positiv oder SRB-negativ) mit allen Proben erhalten (Daten nicht gezeigt). Es wäre jedoch interessant, die Patienten mit IBD über einen längeren Zeitraum zu verfolgen, um festzustellen, ob die Aktivität der Krankheit Auswirkungen auf die SRB-Population hat.

D. desulfuricans wird häufig aus der Umwelt isoliert und wurde bis zur jüngsten Beschreibung von D. fairfieldensis auch als die am weitesten verbreitete Art von Desulfovibrio beim Menschen angesehen. Daher mag man sich über das sehr geringe Vorkommen von D. desulfuricans in unserer Bevölkerung wundern. Bisher wurden D. piger und D. fairfieldensis ausschließlich aus menschlichen Proben isoliert. Unsere Ergebnisse zeigen also, dass beide Spezies spezifisch für den menschlichen Darmtrakt sein können. Dies muss jedoch noch durch die spezifische Suche nach diesen Bakterien in anderen ökologischen Nischen bestimmt werden. D. piger wurde nur einmal beschrieben und galt als ungewöhnlicher Befund beim Menschen. Unsere Ergebnisse zeigen, dass es das häufigste SRB im Darmtrakt sein kann. Diese Art wurde jedoch nie in infektiösen Prozessen beschrieben. Im Gegenteil, D. fairfieldensis, anscheinend weniger häufig im menschlichen Kot, wurde außerhalb des Kolonlumens aus Blut und septischen Sammlungen isoliert . Daher kann D. fairfieldensis im Vergleich zu anderen Arten von Desulfovibrio zusätzliche invasive Eigenschaften besitzen, was seine Erholung aus klinischen Proben erklären würde. Interessanterweise ist in unserer Patientenserie die Prävalenz von D. piger im Kot bei Patienten, die wegen IBD (meist CD) ins Krankenhaus eingeliefert wurden, signifikant höher als bei gesunden Personen oder bei Patienten, die wegen anderer Pathologien ins Krankenhaus eingeliefert wurden. Dies kann zwei Erklärungen haben: entweder D. piger hat physiologische Eigenschaften, die das Auftreten von Läsionen verursachen und / oder an der Aufrechterhaltung chronischer Entzündungsprozesse beteiligt sind, oder die Besiedlung durch diese Spezies wird durch lokale Bedingungen bei IBD-Patienten begünstigt. Die Assoziation von SRB mit IBD wurde bereits beschrieben . D. piger wurde seit seiner Erstbeschreibung im Jahr 1976 nicht weiter betrachtet . Daher ist der Befund, dass dieses Bakterium, das als nicht pathogene Spezies angesehen wird, ein häufiger Bewohner des menschlichen Darmtrakts und die am weitesten verbreitete Art von SRB bei IBD-Patienten ist, überraschend. Zusätzliche Studien sollten durchgeführt werden, um die Art und Weise aufzuklären, in der D. piger an diesen chronischen Entzündungsprozessen beteiligt sein kann.

Danksagungen

Diese Arbeit wurde teilweise von der Compagnie Française de Géothermie (Orléans, Frankreich) und durch einen FCT-Zuschuss POCTI 36562/ESP/2000 an ICP unterstützt. Wir danken dem verstorbenen Dr. Wee Tee (University of Melbourne, Australien) für die freundliche Bereitstellung von vier Stämmen von D. fairfieldensis (einschließlich Stamm ATCC 700045) und auch Prof. D. Raoult (Universität Marseille, Frankreich) für die Bereitstellung eines Stammes von D. fairfieldensis. Wir danken D. Meng und A.M. Carpentier (Laboratoire de Bactériologie-Virologie UMR CNRS 7565) für ihre hervorragende technische Unterstützung, Dr. A. Dao und Prof. B. Fortier für die Bereitstellung von Fäkalien von gesunden Personen sowie die Krankenschwestern der Hepato-Gastro-Enterology Unit für ihre Freundlichkeit.