Le dikaryon est une caractéristique nucléaire unique à certains champignons. L’algue verte Derbesia a longtemps été considérée comme une exception, jusqu’à ce que l’hypothèse hétérocaryote soit contestée par des études ultérieures. Les types de cellules compatibles peuvent fusionner des cytoplasmes (plasmogamie). Lorsque cela se produit, les deux noyaux de deux cellules s’apparient et cohabitent sans fusion (caryogamie). Ceci peut être maintenu pour toutes les cellules des hyphes en se divisant de manière synchrone de sorte que les paires soient transmises à des cellules plus récentes. Chez les Ascomycota, cet attribut se trouve le plus souvent dans les hyphes ascogènes et les ascocarpes, tandis que la majeure partie du mycélium reste monokaryote. Chez les Basidiomycota, c’est la phase dominante, la plupart des monokaryons des Basidiomycota ayant une croissance faible et une durée de vie courte.
La formation d’un dikaryon est un caractère plésiomorphe pour le sous-domaine Dikarya, qui se compose de la Les Basidiomycota et les Ascomycota. La formation de croziers dans les Ascomycota et de connexions à pince dans les Basidiomycota facilite le maintien des dicaryons. Cependant, certains champignons de chacun de ces phylums ont développé d’autres méthodes pour maintenir les dikaryons, et donc ni les croziers ni les connexions à pince ne sont omniprésents dans l’un ou l’autre des phylums.