El 17 de marzo de 1948, Chain fue nombrado miembro de la Royal Society.El 8 de julio de 1969, Chain fue nombrado Caballero Soltero.
Fue amigo de toda la vida del profesor Albert Neuberger, a quien conoció en Berlín en la década de 1930.
En 1948, se casó con Anne Beloff-Chain, hermana de Renee Soskin, Max Beloff, John Beloff y Nora Beloff, y una bioquímica de gran prestigio. En su vida posterior, su identidad judía se volvió cada vez más importante para él. Chain era un ferviente sionista y se convirtió en miembro de la junta de gobernadores del Instituto Weizmann de Ciencias en Rehovot en 1954, y más tarde en miembro del consejo ejecutivo. Crió a sus hijos de forma segura dentro de la fe judía, organizando mucha matrícula extracurricular para ellos. Sus puntos de vista se expresaron más claramente en su discurso «Por qué soy judío» dado en la Conferencia de Intelectuales del Congreso Judío Mundial en 1965.
Chain murió en el Hospital General Mayo en 1979. El edificio de bioquímica del Imperial College de Londres lleva su nombre, al igual que una carretera en Castlebar.