Las manchas oculares en células de cepas blanqueadas con estreptomicina y de cultivos de Euglena gracilis de crecimiento oscuro, se examinaron mediante microscopía de fluorescencia y microspectrofotometría. Cuando se ve con luz en la región de 380-500 nm, el estigma aparece como una mancha oscura. Adyacente a esto había un segundo punto, que no se veía con luz blanca, pero que se veía fluorescente cuando se excitaba con radiación a 370 ± 20 nm. Esta fluorescencia demostró ser polarizada en contraste con otros cuerpos fluorescentes en la célula. Las curvas de absorción, obtenidas por microespectrofotometría de áreas oculares individuales, se encontraron que consistían en dos máximos espectrales, una banda A en el azul y una banda B en el verde. A diferencia de la banda A, la banda B proporcionó evidencia de que se originó a partir de una estructura anisotrópica. Relacionando estos datos con los hallazgos de la literatura, concluimos que la banda B es la absorbancia de un pigmento en el cuerpo paraflagelar cuasi cristalino y la banda A tal vez un pigmento en el estigma rojo anaranjado. El espectro de la banda B no parece ser el de una flavoproteína o de un carotenoide libre, pero su parecido con el espectro de rodopsina es significativo en relación con los datos publicados para la mancha ocular de Chlamydomonas que sugieren la presencia de un pigmento similar a la rodopsina como el sistema fotosensible responsable de la fototaxis en esta alga.