Harper fue elegido por primera vez para el Distrito de Escuelas Secundarias de Huntington Beach Union (HBUHSD) en 1998, reelegido con más votos en 2002, y nombrado para un tercer mandato indiscutible en 2006. Hay cinco miembros de la junta directiva, o fideicomisarios, que son elegidos por los votantes de HBUHSD. El HBUHSD sirve a las necesidades de educación secundaria de las comunidades del condado de Orange de Huntington Beach, la mayor parte de Westminster, la mayor parte de Fountain Valley, una parte de Garden Grove y todas las comunidades no incorporadas de Midway City. Cuatro distritos de escuelas primarias independientes atienden las necesidades de educación primaria del territorio al que atiende el HBUHSD. Las escuelas secundarias en el distrito incluyen: Huntington Beach High School, Westminster High School, Marina High School, Fountain Valley High School, Edison High School, Ocean View High School, Valley Vista High School, Coast High School, Community Day School y Huntington Beach Adult School.
Después de completar su tercer mandato en la Junta Directiva de HBUHSD, el 2 de noviembre de 2010, Harper fue elegido para convertirse en miembro del concejo municipal de Huntington Beach, California. La plataforma de campaña de Harper incluía seguridad pública, infraestructura, desarrollo económico, responsabilidad administrativa y fiscal, derechos de propiedad, libertad personal y oposición a impuestos más altos. En 2012, Harper fue elegida por los alcaldes del Segundo Distrito para formar parte de la Junta Directiva de la Autoridad de Transporte del Condado de Orange (OCTA).
En 2013, Harper se convirtió en el alcalde número 59 de Huntington Beach, California, hasta 2014.
Como alcalde, Harper trabajó para completar el Parque de Patinaje Vans, comenzó la construcción de un nuevo centro para adultos mayores y buscó derogar varias leyes, incluida la prohibición de fuegos artificiales aprobados por el estado en 1987. En sus cuatro años en el Ayuntamiento de Huntington Beach, Harper » construyó una reputación conservadora, pro-empresarial y sin miedo.»
Matthew Harper se desempeñó posteriormente como miembro de la Asamblea Estatal de California para el Distrito 74, abarcando las comunidades costeras del Condado de Orange de Huntington Beach, Costa Mesa, Newport Beach, Irvine, Laguna Woods y Laguna Beach durante dos términos.
De 2007 a 2011, Harper se desempeñó como asesora de políticas y jefa adjunta de personal de la entonces Supervisora del Condado de Orange, Janet Nguyen. En 2011, Harper se desempeñó como miembro designado del Comité de Redistribución de Distritos del Condado de Orange, compuesto por cinco miembros.
Durante dos años, Harper fue el Presidente electo de la Federación de Jóvenes Republicanos de California (YRFC) y sirvió en su junta estatal durante más de diez años. A nivel local, Harper ha sido elegido para varios mandatos en el Comité Central del Partido Republicano del Condado de Orange. Harper ha servido en el comité ejecutivo de la OCGOP. En todo el estado, Harper se desempeñó como Representante Asociado electo del Partido Republicano de California. Como Representante Asociado, Harper fue miembro nato del comité de la plataforma estatal. En 2014, fue elegido para la Asamblea Estatal de California, derrotando al alcalde de Newport Beach, Keith Curry, un compañero republicano. El asambleísta Matthew Harper continúa como delegado del Partido Republicano de California.