a foszforiláz-kináz aktiválása a protein-kináz A-val történő foszforilezést igényli, és a Ca2+ kötődését az a-alegységhez.
az enzimet két folyamat szabályozza: reverzibilis foszforiláció és alloszterikus szabályozás.
az előbbiben a protein kináz A (PKA) döntő szerepet játszik. Ez egy foszfátcsoportot visz át a kezdetben gyengén aktív foszforiláz-kináz fő alegységébe. Ennek eredményeként megnő a kináz aktivitási szintje. Maga a PKA inaktív formából aktiválódik egy második hírnök, a cAMP. A cAMP felszabadulásának egyik oka az olyan hormonok jelenléte, mint az adrenalin és a glukagon.
a foszforiláz-kináz azonban részben aktív formává is aktiválható megnövekedett Ca2+ szinttel. A kalciumérzékelő a calmodulin,amely megfelel az enzim 6 alegységének.
Ha a foszforiláz-kináz mind a foszforilált formában jelen van, mind a kalmodulin kalciumionokat kötött az a) alegységben, az enzim teljesen aktív.