Fujiwara volt Japán első fővárosa, amelyet a kínai modellre épülő rácsmintában építettek (a közelmúltban végzett vizsgálatok kimutatták, hogy a város nagyjából 5 km-es területet fed le, sokkal nagyobb, mint azt korábban gondolták. A palota körülbelül 1 km2-es telket foglalt el, nagyjából 5 m magas falak vették körül. A négy fal mindegyikének három kapuja volt; Suzakumon, a főkapu, a déli fal közepén állt. A daigokuden és más palotaépületek voltak az első palotaépítmények Japánban, amelyek kínai stílusú cseréptetővel rendelkeztek.
a terület korábban a Nakatomi Klán fennhatósága alá tartozott, akik a császári udvar megbízásából felügyelték a Shint-szertartások és szertartások megfigyelését. A város 711-ben, egy évvel a Narába költözés után leégett, és nem építették újjá. A régészeti feltárások 1934-ben kezdődtek, a palota egyes részeit rekonstruálták. Közel 10 000 fából készült tablettát találtak, Mokkan néven, kínai betűkkel írva.
Ez a Waka, amelyet JIT császárné írt, és Fudzsivarát nyáron írja le, a híres versantológia része, a Hyakunin Isshu:
xhamsterharu sugite Natsu ki ni kerashi shirotae no Koromo Hosu Ch .. ama no kaguyama
ami azt jelenti, hogy a tavasz elmúlt, úgy tűnik, és most elérkezett a nyár; mert azt mondják, ez az, amikor tiszta fehér ruhát sugároznak a mennyei Kagu-hegyen.
a fővárost Fujiwara-kyo-ból költöztették, mert a nyílt szennyvízrendszer okozta rendkívüli bűz miatt. A csatorna eltömődött ürülékkel és más emberi hulladékkal, ami felhalmozódott, és nem mosódott a folyóba. A bűz olyan erős lett, hogy az emberek panaszkodni kezdtek a palota bűzére. Végül a fővárost Nara-ba költöztették a szörnyű szag miatt.