I 2001 Flyttet Flowers tilbake til Alabama, hvor Hun konsentrerte seg om økonomisk utvikling som en del av Lowndes County Commission. Befolkningen I Lowndes County er tre fjerdedeler Svart. I 2002 hadde hun identifisert flere feil i det lokale sanitæranlegget; inkludert folk som ble arrestert for ikke å betale for septiske systemer på stedet og folk som betalte for sanitæranlegg på stedet, ble ikke gitt tilstrekkelige bestemmelser. Flowers var overrasket over at regjeringen var rettet mot de fattigste medlemmene i samfunnet i stedet for de mye rikere bedriftens forurensere. Denne erfaringen motiverte henne til å fokusere på miljø rettferdighet og klima. Hun mottok føderal godkjenning Fra United States Environmental Protection Agency (EPA) for å produsere en plan for å adressere rå kloakk i Lowndes County.I 2011 jobbet Flowers med EN Fns Spesialrapportør for å bedre forstå fattigdom og dens innvirkning på infrastruktur i Lowndes County, Alabama. Siden 2015 Har Flowers hatt En stilling Som Senior Fellow ved Center For Earth Ethics. Hun tilbrakte 2017 som En Franklin Humanities Institute Practitioner in Residence Ved Duke University. Hun grunnla Center For Rural Enterprise And Environmental Justice i 2019.Blomster og Columbia Law School Human Rights Institute undersøkte hvordan strukturelle ulikheter påvirker tilgangen til sanitær og rent vann. Hun identifiserte at marginaliserte, fattigdomsrammede landlige samfunn var mer sannsynlig å lide av forurenset vann og dårlig sanitet. Sammen tillater disse spredning av intestinale parasittiske infeksjoner, inkludert hookworm. I 2019 publiserte JoAnn Kamuf Ward And Flowers, Spylt og Glemt: Sanitæranlegg og Avløpsvann i Landlige Samfunn i Usa, der Flowers skrev: «i Lowndes County, Alabama, og mange av de omkringliggende områdene, er mangel på grunnleggende fasiliteter som Mange Amerikanere tar for gitt en livsstil,». Rapporten kom med en rekke anbefalinger, inkludert tiltak for å forbedre ansvarlighet, sikre deltakelse av berørte samfunn i enhver beslutningsprosess og sikre tilgang til tilstrekkelig sanitæranlegg på grunnlag av likestilling.
I 2019 leverte hun ekspertvitne til Den Amerikanske Kongressen der hun oppfordret regjeringen til å takle sykdommene forbundet med fattigdom i Usa. Hun ble utnevnt Til Joe Biden Task Force on Climate Change, som er co-ledet Av Alexandria Ocasio-Cortez. Flowers er det Eneste Svarte medlemmet av arbeidsgruppen.