With one click, MAXIMIZE the chance to obtain functional proteins
Try it Now
Patent Number: WO2020024917A1
Som en ledende leverandør av syntetisk DNA, er GenScript dedikert til å bruke de nyeste fremskrittene for å oppdatere eksisterende algoritmer for å forbedre genuttrykk. Vår nyeste utvikling er Gensmart™ Kodon Optimalisering; et gratis, brukervennlig online verktøy som lar deg optimalisere utformingen av villtype eller rekombinante gensekvenser mot høyere uttrykk i prokaryote og pattedyrs uttrykkssystemer.
Gensmart Hryvnias Kodonoptimalisering bruker en nyutviklet algoritme basert på «Populasjonsimmunalgoritmen», som utnytter både populasjonsgenetikk og immunologiske teorier. I denne tilnærmingen blir mer enn 200 faktorer involvert i genuttrykk, inkludert GC-innhold, kodonbruk og innholdsindeks, rnase-spleisingssteder og cis-virkende mRNA-destabiliserende motiver screenet og validert. I stedet for å bruke en enkeltfaktorsimulering til databehandling, brukes en multifaktortilnærming for å sikre at alle nøkkelfaktorer i en bestemt gensekvens bærer vekt. Som et resultat er hver genoptimalisering fullt tilpasset for å maksimere sjansen for å oppnå et funksjonelt og aktivt protein.
Sammenlignet med lignende verktøy, Er Optimalisering Av Gensmart™ Codon mer tilgjengelig og brukervennlig. Alle parametrene er integrert i algoritmen og krever ingen innspill fra deg. Alt som kreves er din sekvens og ønsket vertsorganisme; resten blir tatt vare på av optimaliseringsverktøyet. I tillegg kan dine optimaliserte sekvenser enkelt bestilles Gjennom Gensmart™ Instant Quote System eller arkiveres for fremtidig bruk.
Oppgradert! Gensmart™ Kodonoptimalisering har blitt brukt på 50 vertsorganismer nå, inkludert CHO, Human, E. coli, T-celle, Gjær, Insekt, Arabidopsis, Mais, Ris, Soyabønne, Fruktfly, etc.!
Hvorfor Gensmart™ Codon Optimization
- Tilgjengelighet: Gratis, online verktøy; bare ett klikk unna til din optimale sekvens
- Omfattende Faktoranalyse: over 200 faktorer screenet og validert
- Avansert Databehandling: Patentert populasjonsimmunalgoritme for å sikre den beste utgangen
- Individuell Sekvensbasert: Svært tilpasset databehandling for å unngå vektfordeling skjevhet på viktige faktorer
- Enkel Bestilling: Sømløs integrasjon med GenSmart™ Instant Quote System
Hva Dataene sier
GenScript Data
Mål: å vurdere ytelsen Til GenSmart™ Kodon Optimaliseringsverktøy for å øke uttrykket AV JNK3 og GFP proteiner.
Tilnærming: Klonet villtype og sekvensoptimaliserte sekvenser av hvert gen i en ekspresjonsvektor og vurdert proteinuttrykk fra tre forskjellige kloner I CHO 3E7-celler gjennom Western blotting.
Resultater: Alle tre gfp-og JNK3-klonene fra sekvenser optimalisert Av GenSmart™ viste en signifikant økning i proteinuttrykk med henholdsvis 18 og ~8 ganger sammenlignet med ikke – optimaliserte native gensekvenser.
Uavhengige Data
Mål: å vurdere redigeringseffektiviteten TIL be4 baseredigeringsvarianter optimalisert av forskjellige kodonoptimaliseringsverktøy som en del av det overordnede målet om å undersøke effekten av genuttrykk på genredigering
tilnærming: Optimalisert kjernelokaliseringskodonet TIL BE4 med verktøy FRA IDT, Coller, GeneArt og GenScript, og deretter vurdert genuttrykk og redigeringseffektivitet i HEK293-celler
Resultater: mens kodoner optimalisert av verktøy Fra GenScript (GS), GeneArt (GA) og Coller (Jc) forbedret redigeringseffektiviteten i forhold TIL IDTS, forbedret kimære varianter optimalisert av Genscripts kodonoptimalisering alene utkonkurrerte andre ved å indusere 1,8 ganger høyere redigeringseffektivitet