De endodermis voorkomt dat water en eventuele opgeloste opgeloste stoffen via de apoplast-route door deze laag gaan. Water kan alleen door de endodermis passeren door het membraan van endodermale cellen twee keer te passeren (een keer om in te voeren en een tweede keer om te verlaten). Water dat in of uit het Xylem beweegt, dat deel uitmaakt van de apoplast, kan daardoor geregeld worden omdat het in de endodermis de symplast moet binnendringen. Hierdoor kan de plant tot op zekere hoogte de beweging van water controleren en selectief opnemen of de doorgang van ionen of andere moleculen voorkomen.
De endodermis staat niet toe dat gasbellen het xylem binnendringen en helpt embolie in de waterkolom te voorkomen.
Passage cellen zijn endodermale cellen van oudere wortels die dunne wanden en casparische strips hebben behouden in plaats van suberized en waterdicht te worden zoals de andere cellen eromheen, om een symplastische stroming naar de binnenkant te blijven toestaan. Experimenteel bewijs suggereert dat passage cellen functioneren om overdracht van opgeloste stoffen zoals calcium en magnesium in de stele, om uiteindelijk het transpiratiesysteem te bereiken. Voor het grootste deel, echter, oude wortels afdichten zich af op de endodermis, en alleen dienen als een doorgang voor water en mineralen opgenomen door jongere wortels “stroomafwaarts”.
endodermale cellen kunnen zetmeelkorrels in de vorm van amyloplasten bevatten. Deze kunnen dienen als voedselopslag, en zijn aangetoond betrokken te zijn bij gravitropism in sommige planten.