mechanizm działania dehydrogenazy 6-fosfoglukonianowej z alternatywnym substratem 2-deoksy-6-fosfoglukonianu badano przy użyciu enzymów z wątroby owczej, ludzkich erytrocytów i Trypanosoma brucei. Trzy enzymy utleniają 2-deoksy-6-fosfoglukonian, ale tylko enzym wątroby owiec uwalnia pośredni 2-deoksy,3-keto-6-fosfoglukonian. Porównanie kinetyczne wykazało, że wzrost szybkości redukcji NADP+ przy wysokim pH jest spowodowany zwiększonym uwalnianiem półproduktu, a nie wzrostem ogólnej szybkości reakcji. 2-deoksy,3-keto-6-fosfoglukonian jest dekarboksylowany przez enzymy erytrocytów i trypanosomów, ale nie wątrobowy w przypadku braku NADPH lub 6-fosfoglukonianu, które działają jako aktywatory. Zależność od pH dekarboksylacji i stopień aktywacji sugerują, że 6-fosfoglukonian jest aktywatorem, który działa w normalnych warunkach testowych, podczas gdy NADPH działa głównie poprzez zwiększenie wiązania półproduktu. Dane sugerują, że aktywność 6PGDH podlega dwukierunkowej regulacji: NADPH, który reguluje szlak fosforanu pentozy, hamuje enzym, podczas gdy 6-fosfoglukonian, którego poziom wzrasta po usunięciu hamowania NADPH, działa jako aktywator zapewniający szybkie usunięcie 6-fosfoglukonianu.