światło nie przenika bardzo daleko do oceanu, więc okręty podwodne muszą poruszać się po wodzie praktycznie ślepo. Okręty podwodne są jednak wyposażone w mapy nawigacyjne i zaawansowany sprzęt nawigacyjny. Na powierzchni zaawansowany globalny system pozycjonowania (GPS) dokładnie określa szerokość i długość geograficzną, ale ten system nie może działać, gdy łódź podwodna jest zanurzona. Pod wodą okręt podwodny wykorzystuje inercyjne systemy naprowadzania (elektryczne, mechaniczne), które śledzą ruch statku ze stałego punktu startowego za pomocą żyroskopów. Inercyjne systemy naprowadzania działają z dokładnością do 150 godzin i muszą być wyrównane przez inne zależne od powierzchni Systemy nawigacyjne (GPS, radio, radar, Satelita). Dzięki tym systemom okręt podwodny może być dokładnie nawigowany i znajdować się w odległości stu stóp od zamierzonego kursu.
aby zlokalizować cel, okręt podwodny wykorzystuje Sonar aktywny i pasywny (nawigacja dźwiękowa i zasięg). Aktywny sonar emituje impulsy fal dźwiękowych, które podróżują przez wodę, odbijają się od celu i wracają na statek. Znając prędkość dźwięku w wodzie i czas, w którym fala dźwiękowa przemieszcza się do celu iz powrotem, komputery mogą szybko obliczyć odległość między łodzią podwodną a celem. Wieloryby, delfiny i nietoperze używają tej samej techniki do lokalizowania zdobyczy (echolokacji). Sonar pasywny polega na słuchaniu dźwięków generowanych przez cel. Systemy sonarowe mogą być również używane do wyrównywania inercyjnych systemów nawigacyjnych poprzez identyfikację znanych cech dna oceanicznego .
Reklama