a desnaturação térmica do ADN, também chamada fusão, faz com que a estrutura da dupla hélice se desenrole para formar ADN de cadeia simples. Quando o DNA em solução é aquecido acima de sua temperatura de fusão (geralmente mais de 80 ° C), O DNA de cadeia dupla se desenrola para formar DNA de cadeia simples. As bases tornam-se imparáveis e podem assim absorver mais luz. Em seu estado nativo, as bases do DNA absorvem a luz na região de comprimento de onda de 260 nm. Quando as bases se desanuviam, o comprimento de onda da absorvância máxima não muda, mas a quantidade absorvida aumenta 37%. Uma cadeia de DNA de cadeia dupla dissociando-se a duas cadeias individuais produz uma transição cooperativa aguda.
Hipercromicidade pode ser usada para rastrear a condição do DNA como mudanças de temperatura. A temperatura de transição / fusão (Tm) é a temperatura em que a absorvância da luz UV se situa a 50% entre o máximo e o mínimo, ou seja, em que 50% do ADN é desnaturado. Um aumento de dez vezes da concentração de catião monovalente aumenta a temperatura em 16,6 °C.
o efeito hipercrómico é o aumento impressionante da absorvância do ADN após a desnaturação. As duas cadeias de DNA são unidas principalmente pelas interações de empilhamento, ligações de hidrogênio e efeito hidrofóbico entre as bases complementares. A ligação de hidrogênio limita a ressonância do anel aromático de modo que a absorvância da amostra é limitada também. Quando a dupla hélice de ADN é tratada com agentes desnaturados, a força de interacção que mantém a estrutura helicoidal dupla é interrompida. A dupla hélice então se separa em dois fios únicos que estão na conformação enrolada aleatória. Neste momento, a interação base-base será reduzida, aumentando a absorvância UV da solução de DNA porque muitas bases estão em forma livre e não formam ligações de hidrogênio com bases complementares. Consequentemente, a absorvância do ADN de cadeia simples será 37% superior à do ADN de cadeia dupla na mesma concentração.