före nuet innan du når Harbor Boulevard fortsatte SR 39 norrut från Whittier Boulevard längs Hacienda Road till Los Angeles/Orange County line sedan norrut på Hacienda Boulevard och Glendora Avenue till US 60, 70 och 99 (Garvey Avenue, nu Interstate 10) i West Covina. Den fortsatte sedan österut med US 60, 70 och 99 till Azusa Avenue där den vände norrut för att följa den nuvarande inriktningen som beskrivs med början i fjärde stycket i föregående avsnitt. Hacienda Glendora-segmentet kan fortfarande ses som Route 39 på vissa kartor.
före 1991 skulle Harbor Boulevard bli Fullerton Road på väg norrut vid Los Angeles/Orange County-linjen och skulle fortsätta norrut som Fullerton Road även om Puente Hills som en slingrande väg med en körfält in i Rowland Heights. På grund av klagomål från närliggande invånare på grund av den ökade trafikvolymen byggdes dock en rakare, bredare stubbe något österut och fick namnet Harbor Boulevard. Denna rutt övervägs att bli en del av SR 39 för att slutföra klyftan.
den nya Harbor Boulevard öppnades för allmänheten tidigt 1992 och fungerar nu som den primära passagen mellan Orange County och Rowland Heights. Det ursprungliga slingrande Fullerton Road-segmentet finns fortfarande men fungerar inte längre som den primära passagen. Det är nu strikt en bostadsgata.
den 10 juli 2006 rapporterade Pasadena Star-News att staten tillhandahöll finansiering för en Miljökonsekvensrapport (EIR) i juni 2006 för att bedöma möjligheten att återuppta Highway 39 I Angeles National Forest.
en 4,5 mil (7.2 km) vägsträckan, från Snöfjädrar norr om Azusa till motorväg 2, har varit stängd för allmänheten sedan 1978 på grund av en massiv lera och stenskred. Medan vägen är passabel för utryckningsfordon under hela den stängda längden, sektioner nära återkommande bergrutschbanor blir smala grusvägar som inte är lämpliga för personbilar. EIR kommer att ta tre år att slutföra, enligt California Department of Transportation (Caltrans) tjänstemän.
motorvägen öppnades för räddningspersonal i februari 2003 efter att en Caltrans-studie visade att det inte skulle skada våtmarker, luft-och vattenkvalitet, naturlig vegetation eller hotade växter och djur.
enligt Caltrans District Seven ”Inside Seven” – nyhetsbrevet var arbetet att fortsätta under 2009 och 2010 om återuppbyggnad och installation av funktioner för att förhindra att framtida bilder skadar vägbanan:
”två projekt som kommer att ta itu med dessa problem och få motorvägen att öppnas igen är planerade att byggas snart. Den första, som byggde två stödmurar nära staden Azusa från Old San Gabriel Canyon Road till cirka fyra mil söder om SR-2, kunde börja i mitten av 2009. Det andra, ett projekt på 45 miljoner dollar för att rekonstruera vägbanan, bygga soldathögar, reparera dräneringssystem, installera bergfallskydd och tillhandahålla asfaltbetongöverdrag och trafikband, bör börja hösten 2010.”
men på grund av budgetfrågor försökte Caltrans 2012 istället överföra ansvaret för hela SR 39 norr om postmile LA 17.81 (inklusive det stängda avsnittet) till antingen US Forest Service eller Los Angeles County, som båda minskade, också av ekonomiska skäl, även om både USFS och länet anser att rutten är ”nödvändig”. Att överge rutten skulle inte heller vara kostnadseffektivt för Caltrans på grund av bland annat federala miljöåterställningskrav relaterade till närvaron av bighornfår. Förslaget övergavs efter motstånd från lokala invånare och länet, liksom betydande lagligt tryck från Skogstjänsten, som hotade att genomdriva ett gammalt kontrakt som kräver att Caltrans helt dekonstruerar motorvägen om den vägrar att behålla den. Det finns förslag om att flytta den stängda porten norrut två mil till ett populärt spårhuvud.
Människor på väg till Mount Waterman måste för närvarande resa västerut till Pasadena och gå med i Angeles Crest Highway (Highway 2) i La Ca Brasiliada Flintridge – en nästan två timmars resa. Återöppning Highway 39 skulle minska körtiden till Waterman ski area i hälften och förkorta resan österut till Wrightwood.