den 17 mars 1948 utsågs Chain till stipendiat av Royal Society.Den 8 juli 1969 utsågs Chain till en Knight Bachelor.
Han var en livslång vän till professor Albert Neuberger, som han träffade i Berlin på 1930-talet.
1948 gifte han sig med Anne Beloff-Chain, syster till Renee Soskin, Max Beloff, John Beloff och Nora Beloff, och en biokemist med betydande ställning själv. I hans senare liv blev hans judiska identitet allt viktigare för honom. Chain var en ivrig sionist och han blev medlem i styrelsen för Weizmann Institute of Science i Rehovot 1954 och senare medlem av verkställande rådet. Han uppfostrade sina barn säkert inom den judiska tron och ordnade mycket extracurricular undervisning för dem. Hans åsikter uttrycktes tydligast i hans tal ’Varför jag är en jude’ som gavs vid World Jewish Congress Conference of Intellectuals 1965.
kedjan dog på Mayo General Hospital 1979. Imperial College London biochemistry building är uppkallad efter honom, liksom en väg i Castlebar.