experimentet innefattar tre huvudsteg:
- behandlingen appliceras på ett prov av celler.
- cellerna ”pläteras” i ett vävnadsodlingskärl och får växa.
- de producerade kolonierna är fixerade, färgade och räknade.
Vid slutet av experimentet mäts procentandelen celler som överlevde behandlingen. En grafisk representation av överlevnad kontra läkemedelskoncentration eller dos av joniserande strålning kallas en cellöverlevnadskurva.
För celldödande Partikelanalyser används den överlevande fraktionen av celler för att approximera Poissonfördelningen av viruspartiklar mellan celler och bestämmer därför antalet CKPs som varje cell stöter på.
vilken typ av cell som helst kan användas i ett experiment, men eftersom målet med dessa experiment i onkologisk forskning är upptäckten av effektivare cancerbehandlingar är humana tumörceller ett typiskt val. Cellerna kommer antingen från beredda” cellinjer”, som har studerats väl och vars allmänna egenskaper är kända, eller från en biopsi av en tumör hos en patient. Cellerna sätts i petriskålar eller i plattor som innehåller flera cirkulära ”brunnar.”Särskilt antal celler är pläterade beroende på experimentet; för ett experiment som involverar bestrålning är det vanligt att plåta större antal celler med ökande dos av strålning. Till exempel, vid en dos av 0 eller 1 grå strålning, kan 500 celler pläteras, men vid 4 eller 5 Grå kan 2500 pläteras, eftersom mycket stort antal celler dödas vid denna strålningsnivå och effekterna av den specifika behandlingen skulle vara observerbara.
att räkna cellkolonierna görs vanligtvis under ett mikroskop och är ganska tråkigt. Nyligen har maskiner utvecklats som använder algoritmer för att analysera bilder. Dessa fångas antingen av en bildskanner eller ett automatiserat Mikroskop som helt kan automatisera räkningsprocessen. En sådan automatiserad maskin fungerar genom att acceptera vissa typer av cellplattor genom en kortplats (inte till skillnad från en CD-spelare), ta ett fotografi och ladda upp det till en dator för omedelbar analys. Tillförlitliga räkningar är tillgängliga på några sekunder.