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Hypogées, hypogées, hypogées et hypogées (signifiant « souterrain », du grec hypó « sous » + gaîa « terre ») sont des termes biologiques décrivant l’activité d’un organisme sous la surface du sol.
En botanique, une graine est décrite comme présentant une germination hypogéale lorsque les cotylédons de la graine en germination restent non photosynthétiques, à l’intérieur de la coquille de la graine et sous terre. L’inverse, où les cotylédons se dilatent, rejettent la coquille de la graine et deviennent photosynthétiques au-dessus du sol, est la germination épigéale.
Dans les travaux de purification de l’eau, la couche hypogéale (ou de Schmutzdecke) est un film biologique juste sous la surface des filtres à sable lents. Il contient des micro-organismes qui éliminent les bactéries et emprisonnent les particules contaminantes.
Les termes hypogéiques et hypogéiques sont utilisés pour les organismes cavernicoles fossoriaux (fouisseurs) et troglobitiques (ou stygobitiques). Les termes opposés sont épigéens et épigéiques.
Le terme hypogée est utilisé pour les champignons avec des fructifications souterraines – par exemple, les truffes. Le terme opposé est épigé.