kapanie mgły jest kluczem do bogatej różnorodności gatunków w Dolinie San Pedro, najprawdopodobniej dostarczając do jednej trzeciej rocznej dostępnej wilgoci w tym ekosystemie i utrzymując chłodne, jasne widły San Pedro Creek przez cały rok.
Góra Montara i Sweeney Ridge nie są pokryte gęstą sekwoją przybrzeżną (Sequoia sempervirens) i Daglezją przybrzeżną (Pseudotsuga menziesii var. menziesii) typowe dla reszty gór Santa Cruz na południu. Pierwsi hiszpańscy osadnicy opisywali grzbiety gór jako pozbawione wysokich drzew. Ostatnio posadzono tylko wysokie drzewa: eukaliptus, sosnę Monterey i cyprys Monterey. Obszar od góry Montara na północ do złotej bramy stanowi unikalną jednostkę biogeograficzną nazwaną „krajobrazem Franciszkańskim”, która jest przede wszystkim przybrzeżnym Zaroślem zdominowanym przez szczotkę kojota, a także chroni unikalne endemiczne gatunki występujące nigdzie indziej. Szlak orzechów laskowych w San Pedro Valley County Park jest dobrym miejscem do zobaczenia tych niezwykłych gatunków, które obejmują Giant Golden Chinaquapin, Montara Manzanita, cuchnące żmije-tongue i California Leszczyny. Te i inne rośliny, takie jak Wake robins, Coast and Giant trillium, smukła fałszywa pieczęć Salomona i cuchnący język żmija kwitną między skupiskami łodyg Krzewów i kępami paproci mieczowej. Cuchnący język żmiji-z cętkowanymi zielonymi liśćmi, brązowo—fioletowymi kwiatami w paski i zapachem gnijącego ciała-jest szczególnie obfity. Fakt, że gatunki te zwykle rosną w zacienionych lasach sekwoi i daglezji, doprowadził do spekulacji, że przed 5000-letnią okupacją Indian Ohlone, którzy prawdopodobnie spalili ten obszar, aby promować wzrost naturalnych źródeł żywności, że górny dział wodny San Pedro mógł być gospodarzem pierwotnych lasów iglastych.
Dereń potokowy, Wierzba Arroyo, rukiew wodna i kilka gatunków paproci są powszechne w środkowym i dolnym biegu. Wiosną na łąkach Doliny Środkowej można podziwiać szereg kwiatów polnych: Kalifornijskie maki, słoneczniki, jaskry, Dzika rzodkiewka i dzika musztarda. Dzika przyroda jest obfita w Dolinie San Pedro. Mieszkańcy parku często widywani są Jastrzębie, sępy indycze, przepiórki, zarośla i węże Podwiązkowe. Rzadziej spotykane są jelenie, Bobkaty, Lisy szare, szopy, króliki i węże Susłowate. Trzy rozwidlenia San Pedro i jego dopływu Brooks Creek zapewniają krytyczne miejsca tarła dla pstrąga stalowego (Oncorhyncus mykiss). Okres tarła steelhead trwa zwykle od grudnia do lutego.