With one click, MAXIMIZE the chance to obtain functional proteins
Try it Now
Patent Number: ULD2020024917A1
som en førende leverandør af syntetisk DNA er GenScript dedikeret til at bruge de nyeste fremskridt til at opdatere eksisterende algoritmer til forbedring af genekspression. Vores seneste udvikling er GenSmart-Kodonoptimering; et gratis, brugervenligt online værktøj, der giver dig mulighed for at optimere designet af vildtype eller rekombinante gensekvenser mod højere ekspression i prokaryote og pattedyrekspressionssystemer.
GenSmart – Kodonoptimering bruger en nydesignet algoritme baseret på” Population Immunalgoritme”, der drager fordel af både populationsgenetik og immunologiteorier. I denne tilgang screenes og valideres mere end 200 faktorer involveret i genekspression, herunder GC-indhold, kodonbrug og indholdsindeks, RNase-splejsningssteder og cis-virkende mRNA-destabiliserende motiver. I stedet for at anvende en enkeltfaktorsimulering til computing anvendes en multifaktortilgang for at sikre, at alle nøglefaktorer i en bestemt målgensekvens bærer vægt. Som et resultat er hver genoptimering fuldt tilpasset for at maksimere chancen for at opnå et funktionelt og aktivt protein.
sammenlignet med lignende værktøjer er GenSmart-Kodonoptimering mere tilgængelig og brugervenlig. Alle parametre er integreret i algoritmen og kræver ingen input fra dig. Alt, hvad der kræves, er din sekvens og ønskede værtsorganisme; resten er taget hånd om af optimeringsværktøjet. Derudover kan dine optimerede sekvenser nemt bestilles via GenSmart Prisforslagssystem eller arkiveres til fremtidig brug.
opgraderet! GenSmart-Kodonoptimering er blevet anvendt på 50 værtsorganismer nu, herunder CHO, Human, E. coli, T-celle, gær, insekt, Arabidopsis, majs, ris, sojabønne, frugtflue osv.!
hvorfor Gensmart Karp Codon optimering
- tilgængelighed: gratis, online værktøj; kun et klik væk til din optimale sekvens
- omfattende faktoranalyse: over 200 faktorer screenet og valideret
- avanceret Computing: patenteret populationsimmunalgoritme for at sikre den bedste output
- individuel Sekvensbaseret: Meget tilpasset computing for at undgå vægtallokeringsforstyrrelse på nøglefaktorer
- nem bestilling: problemfri integration med GenSmart Price Instant Citat System
hvad dataene siger
GenScript Data
formål: at vurdere ydeevnen for Gensmart Price Codon optimeringsværktøj til at øge ekspressionen af jnk3 og GFP proteiner.
tilgang: klonede den vilde type og sekvensoptimerede sekvenser af hvert gen i en ekspressionsvektor og vurderede proteinekspression fra tre forskellige kloner i CHO 3e7 celler gennem vestlig blotting.
resultater: Alle tre GFP-og JNK3-kloner fra sekvenser optimeret af GenSmart kur viste en signifikant stigning i proteinekspression med henholdsvis 18 og ~8 gange sammenlignet med ikke – optimerede native gensekvenser.
uafhængige Data
formål: at vurdere redigeringseffektiviteten af BE4 base editor varianter optimeret af forskellige kodonoptimeringsværktøjer som en del af det overordnede mål om at undersøge effekten af genekspression på genredigering
tilgang: Optimeret det nukleare lokaliseringskodon af BE4 med værktøjer fra IDT, Coller, GeneArt og GenScript og vurderede derefter genekspression og redigeringseffektivitet i HEK293 celler
resultater: mens kodoner optimeret af værktøjer fra GenScript (GS), geneart (GA) og Coller (JC) forbedrede redigeringseffektiviteten i forhold til IDT ‘er, kimære varianter optimeret af GenScript’ s kodonoptimering alene overgik andres ved at inducere 1,8 gange højere redigeringseffektivitet