Le brouillard d’égouttement est la clé de la riche diversité d’espèces dans la vallée de San Pedro, fournissant probablement jusqu’à un tiers de l’humidité annuelle disponible dans cet écosystème et gardant les fourches fraîches et claires du ruisseau San Pedro toute l’année.
La montagne de Montara et la crête de Sweeney ne sont pas recouvertes par le séquoia de la Côte (Sequoia sempervirens) et le douglas taxifolié de la Côte (Pseudotsuga menziesii var. menziesii) typique du reste des montagnes de Santa Cruz au sud immédiat. Les premiers colons espagnols ont décrit les crêtes des cours supérieurs comme dépourvues de grands arbres. Les seuls grands arbres ont été plantés récemment et comprennent l’eucalyptus, le pin de Monterey et le cyprès de Monterey. La zone allant de la montagne Montara au nord jusqu’au Golden Gate représente une unité bio-géographique unique surnommée le « Paysage franciscain », qui est principalement un Maquis côtier dominé par des Broussailles de Coyotes et abrite également des espèces endémiques uniques que l’on ne trouve nulle part ailleurs. Le sentier des noisettes dans le parc du comté de San Pedro Valley est un bon endroit pour voir ces espèces inhabituelles qui comprennent le Chinaquapin Doré géant, le Manzanita de Montara, la langue des additionneurs fétides et la Noisette de Californie. Ces plantes et d’autres comme le robinier de Sillage, le trillium côtier et géant, le faux phoque de Salomon élancé et la langue de l’additionneur fétide s’épanouissent entre des tiges d’arbustes groupées et des touffes de fougère épée. La langue de l’additionneur fétide — avec ses feuilles vertes tachetées, ses fleurs rayées brun-violet et son odeur de chair pourrie — est particulièrement abondante. Le fait que ces espèces poussent normalement dans le sous-étage ombragé des forêts de séquoias et de sapins de Douglas a conduit à spéculer qu’avant l’occupation de 5 000 ans des Indiens Ohlone, qui ont probablement brûlé la région pour favoriser la croissance de sources de nourriture naturelles, le bassin versant supérieur de San Pedro pourrait avoir été l’hôte de forêts de conifères primordiales.
Le cornouiller du ruisseau, le saule d’Arroyo, le cresson et plusieurs espèces de fougères sont communs dans les ruisseaux moyens et inférieurs. Au printemps, les prairies de la Moyenne Vallée offrent un éventail de fleurs sauvages: Coquelicots de Californie, Gobelets Solaires, Renoncules, Radis Sauvage et Moutarde Sauvage. La faune est abondante dans la vallée de San Pedro. Les habitants du parc sont souvent des faucons à queue rousse, des vautours à Dinde, des cailles, des Geais et des couleuvres Jarretières. Parmi ceux qui sont observés moins fréquemment, mentionnons les cerfs, les Lynx roux, les Renards gris, les ratons laveurs, les Lapins et les Serpents à gopher. Les trois fourches du San Pedro et de son affluent le ruisseau Brooks fournissent des zones de frai critiques pour la truite arc-en-ciel (Oncorhyncus mykiss). La saison de frai de la truite arc-en-ciel s’étend normalement de décembre à février.