With one click, MAXIMIZE the chance to obtain functional proteins
Try it Now
Patent Number: WO2020024917A1
Como um fornecedor líder de DNA sintético, o GenScript é dedicado a usar os últimos avanços para atualizar algoritmos existentes para melhorar a expressão genética. Nosso desenvolvimento mais recente é a otimização do Codon GenSmart™; uma ferramenta online livre e fácil de usar que lhe permite otimizar o design de tipos selvagens ou sequências de genes recombinantes para uma expressão mais elevada em sistemas de expressão procariótica e mamífero.
GenSmart™ Codon Optimization uses a newly-designed algorithm based on the” Population Immune Algorithm”, which takes advantage of both population genetics and immunology theories. Nesta abordagem, mais de 200 fatores envolvidos na expressão genética, incluindo o conteúdo GC, o uso de codon e índice de conteúdo, sites de splicing RNase, e motivos desestabilizadores de mRNA de ação cis são rastreados e validados. Em vez de aplicar uma simulação de um único factor à computação, utiliza-se uma abordagem multifactor para garantir que todos os factores-chave numa determinada sequência genética-alvo têm peso. Como resultado, cada otimização genética é totalmente personalizada para maximizar a chance de obter uma proteína funcional e ativa.
em comparação com ferramentas similares, a otimização do Codon GenSmart™ é mais acessível e fácil de usar. Todos os parâmetros são integrados no algoritmo e não requerem nenhuma entrada de você. Tudo o que é necessário é a sua sequência e organismo hospedeiro desejado; o resto é tratado pela ferramenta de otimização. Além disso, suas sequências otimizadas podem ser facilmente encomendadas através do sistema de citações instantâneas GenSmart™ ou arquivadas para uso futuro.atualizado! GenSmart™ Codon Optimization has been applied to 50 host organisms now, including CHO, Human, E. coli, T cell, levedura, Insect, Arabidopsis, milho, Rice, Soybean, Fruit fly, etc.!
Por GenSmart™ Codão de Otimização
- Acessibilidade: ferramenta on-line Gratuita; apenas um clique de distância para a sua ótima sequência
- Abrangente Fator de Análise: Mais de 200 fatores avaliados e validados
- Avançadas de Computação: sistema Patenteado de população imunológico algoritmo para garantir a melhor saída
- Sequência Individuais-com Base: Altamente personalizados de computação para evitar o peso de alocação de preconceito em fatores-chave
- Fácil de Ordenação: uma integração Perfeita com GenSmart™ Instantâneas Sistema de Cotação
o Que os Dados Dizem
GenScript de Dados
Objetivo: avaliar o desempenho de GenSmart™ Codão ferramenta de Otimização para aumentar a expressão de JNK3 e GFP proteínas.abordagem
: clonou o tipo selvagem e sequências optimizadas de cada gene num vector de expressão e avaliou a expressão proteica de três clones diferentes nas células CHO 3E7 através da coagulação Ocidental.resultados: Todos os três clones GFP e JNK3 de sequências otimizadas pelo GenSmart™ mostraram um aumento significativo na expressão proteica em 18 e ~8 vezes, respectivamente, em comparação com sequências nativas não otimizadas.
Independente de Dados
Objectivo: Para avaliar a edição de eficiência de BE4 da base de dados de editor de variantes otimizado por diferentes códons ferramentas de otimização, como parte do objetivo de investigar o efeito da expressão genética no gene edição
Abordagem: Otimizado nuclear localização codão de BE4 com ferramentas de IDT, Coller, GeneArt e GenScript e, em seguida, avaliada a expressão do gene e de edição de eficiência em células HEK293
os Resultados: Enquanto códons otimizados por meio de ferramentas de GenScript (GS), GeneArt (GA) e Coller (JC) melhor edição de eficiência em relação à IDT, a quimérica variantes otimizado por GenScript do codão de otimização sozinho superou outros através da indução de 1,8 vezes maior do que a edição de eficiência